PRJNA320842：滤泡性淋巴瘤转化相关基因组拷贝数异常的全基因组分析 [基因表达]
数据围绕滤泡性淋巴瘤转化过程中的全基因组拷贝数分析，并包含基因表达相关数据。可用于研究该肿瘤转化相关的基因组异常与转录组特征，支撑分类等分析任务（来源 NCBI）
![PRJNA320842: Genome-wide copy number analyses reveal genomic abnormalities involved in transformation of follicular lymphoma [gene expression]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/90054.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA320842：滤泡性淋巴瘤转化相关基因组拷贝数异常的全基因组分析 [基因表达]
PRJNA320842 是一个围绕滤泡性淋巴瘤转化过程展开的全基因组拷贝数分析项目，同时包含基因表达相关数据。该数据集以 Homo sapiens（人类）为研究对象，在 NCBI 的 BioProject 数据库中登记，编号为 320842。从主题标签来看，其数据类型归属于转录组或基因表达范畴。整体而言，该数据集可用于研究滤泡性淋巴瘤在转化过程中出现的基因组异常及其转录组特征，为肿瘤分类等相关分析任务提供数据支撑。其英文全称为 “Genome-wide copy number analyses reveal genomic abnormalities involved in transformation of follicular lymphoma [gene expression]”，本站将其归类于肿瘤 / 淋巴瘤方向，来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据集背景】
滤泡性淋巴瘤是一种起源于人类的肿瘤类型，其转化过程涉及基因组层面的异常改变。该数据集正是围绕这一转化过程而建立，旨在通过全基因组拷贝数分析揭示其中涉及的基因组异常，并纳入基因表达相关数据。项目来源于 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一项单一研究计划而汇集的一组生物学数据，这些数据源自单一机构或联合体；每条 BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集即属于此类记录，聚焦于滤泡性淋巴瘤转化相关的基因组与转录组研究。
【数据内容】
该数据集的核心内容为全基因组拷贝数分析，用于揭示滤泡性淋巴瘤转化过程中涉及的基因组异常，同时包含基因表达相关数据。其主题标签为 “Transcriptome or Gene expression”，表明数据涉及转录组或基因表达层面。数据集英文名称中亦明确标注了 “[gene expression]”，进一步说明基因表达数据是其组成部分。本站分类将其归入肿瘤 / 淋巴瘤方向。除上述信息外，关于样本数量、具体基因列表、拷贝数变异位点、表达量数值等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，登记于 NCBI 的 BioProject 数据库，项目编号为 320842，物种为 Homo sapiens。其英文全称中包含 “PRJNA320842” 这一项目标识。关于具体的采集方法、实验平台、样本处理流程、测序深度、时间跨度等信息，源站未提供。
【适用场景】
依据其主题与内容，该数据集可用于研究滤泡性淋巴瘤转化相关的基因组异常与转录组特征，并支撑分类等分析任务。其全基因组拷贝数分析与基因表达数据的组合，适合用于探索肿瘤转化过程中基因组层面的变化及其与基因表达之间的联系。关于更具体的应用场景、推荐分析流程或下游任务类型，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供关于该数据集具体使用方法的说明，包括数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析工具或流程等均未在已有信息中体现。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、覆盖度、潜在偏差或使用限制等方面的说明。
【引用与许可】
源站未提供关于该数据集的引用方式、许可条款或使用授权等方面的信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA320842
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用单核苷酸多态性芯片对277例淋巴瘤样本（其中198例为滤泡性淋巴瘤[FL]，79例为转化型FL[tFL]）进行了研究，旨在识别驱动FL发展及其向弥漫大B细胞淋巴瘤转化的继发性染色体异常。此数据集对应于GSE67385系列中部分tFL病例可获取的基因表达数据。总体设计：从转化型滤泡性淋巴瘤病例中获取冷冻肿瘤活检样本。按照标准的Affymetrix方案提取总RNA并处理，随后与Affymetrix HG-U133 plus 2芯片进行杂交。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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