IkB样蛋白NFKBIZ调控NF-kB信号并对ABC DLBCL生存至关重要(NFKBIZ抑制)
项目聚焦 IkB 样蛋白 NFKBIZ 对 NF-kB 信号的调控,以及其对 ABC DLBCL 生存的关键作用,并涉及 NFKBIZ 抑制条件

基本信息
资源简介
IkB样蛋白NFKBIZ调控NF-kB信号并对ABC DLBCL生存至关重要(NFKBIZ抑制)
该数据集为 NCBI BioProject 收录的人类(Homo sapiens)项目,编号 203204,英文名称为“PRJNA203204: IkB-like protein NFKBIZ regulates NF-kB signaling and is critical for survival of ABC DLBCL (NFKBIZ inhibition)”。项目聚焦 IkB 样蛋白 NFKBIZ 对 NF-kB 信号的调控,以及其对 ABC DLBCL 生存的关键作用,并涉及 NFKBIZ 抑制条件。从主题标签看,该项目属于转录组或基因表达范畴,本站将其归类为肿瘤 / 淋巴瘤方向。整体而言,该项目围绕 NFKBIZ 在 ABC DLBCL 中的功能与信号调控展开,适合关注 NF-kB 信号通路、ABC DLBCL 生存机制及 NFKBIZ 抑制相关研究的人员参考。
【数据集背景】
该项目来源于 NCBI BioProject,源站标题为“Homo sapiens (ID 203204) - BioProject - NCBI”。BioProject 是围绕单一研究计划组织起来的生物数据集合,通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口,用于查找该项目所产生的多种数据类型。该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据与转录组或基因表达相关。项目名称直接指向 IkB 样蛋白 NFKBIZ 对 NF-kB 信号的调控,以及 NFKBIZ 对 ABC DLBCL 生存的关键作用,并明确涉及 NFKBIZ 抑制条件。
【数据内容】
该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明其数据内容属于转录组或基因表达类型。项目名称涉及 NFKBIZ 抑制条件,并围绕 NFKBIZ 调控 NF-kB 信号及其对 ABC DLBCL 生存的关键作用展开。除上述信息外,源站未提供更具体的数据内容说明,例如样本数量、测序平台、表达矩阵或差异分析结果等。
【采集与来源】
该项目来自 NCBI BioProject,源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 203204,物种为 Homo sapiens。BioProject 记录本身是相关生物数据的集合入口,用于汇集由单一研究计划产生的多种数据类型。关于样本采集地点、采集时间、实验处理细节及具体机构信息,源站未提供。
【适用场景】
该项目适用于与转录组或基因表达相关的研究场景,尤其是围绕 NF-kB 信号调控、IkB 样蛋白 NFKBIZ 功能、ABC DLBCL 生存机制以及 NFKBIZ 抑制条件的研究。由于本站分类为肿瘤 / 淋巴瘤,该项目也可作为淋巴瘤相关研究中的参考数据资源。具体分析场景、可支持的假设或可复现的研究问题,源站未提供。
【使用方法】
该项目可通过 NCBI BioProject 记录进行访问,用户可借助 BioProject 提供的统一入口查找与该项目相关的多种数据类型。关于数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具要求,源站未提供。
【质量与限制】
该项目为 NCBI BioProject 收录记录,其描述强调 BioProject 作为单一研究计划相关生物数据的集合入口。关于数据质量指标、覆盖度、批次效应、样本代表性或使用限制,源站未提供。
【引用与许可】
关于该项目的引用方式与许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA203204
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
核因子-κB(NF-κB)通路的组成性激活是弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)活化B细胞样(ABC)亚型的标志。已发现导致该致癌通路组成性活化的NF-κB调控因子的反复突变。然而,特定靶基因如何被调控仍不清楚。我们发现,与GCB DLBCL原发患者样本相比,结合NF-κB亚基并增强某些NF-κB靶基因反式激活同时抑制其他靶基因的IκB样蛋白NFKBIZ在ABC中表达上调(p=5.1 x 10^-37)。通过RNA干扰敲低NFKBIZ对ABC DLBCL细胞系具有毒性,但对GCB DLBCL细胞系无毒性。NFKBIZ敲低后的基因表达谱分析显示大量NF-κB靶基因显著下调,表明其在调控NF-κB信号传导中发挥核心作用。为进一步探究NFKBIZ在ABC DLBCL中介导NF-κB信号传导的分子机制,我们进行了免疫沉淀实验,检测到NFKBIZ与p50和p52 NF-κB亚基均存在相互作用,表明经典和非经典NF-κB通路均受NFKBIZ调控。
总体而言,我们的数据表明NFKBIZ是ABC DLBCL中NF-kB信号传导所必需的,因此可能成为未来治疗的一个有前景的分子靶点。完整数据集包含三项实验,均使用雄性HBL-1 ABC DLBCL细胞系:a) 通过shRNA抑制NFKBIZ后的8组配对GEP测量,b) 应用MLN抑制剂后的6组配对GEP测量,c) 应用MALT抑制剂后的4组双色测量。总体设计:该数据集包括通过shRNA抑制NFKBIZ后的8组配对GEP测量。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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