IkB样蛋白NFKBIZ调控NF-kB信号并对ABC DLBCL生存至关重要(NFKBIZ抑制)

项目聚焦 IkB 样蛋白 NFKBIZ 对 NF-kB 信号的调控,以及其对 ABC DLBCL 生存的关键作用,并涉及 NFKBIZ 抑制条件

sra
浏览 19
时间序列分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA203204: IkB-like protein NFKBIZ regulates NF-kB signaling and is critical for survival of ABC DLBCL (NFKBIZ  inhibition)

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

IkB样蛋白NFKBIZ调控NF-kB信号并对ABC DLBCL生存至关重要(NFKBIZ抑制)

该数据集为 NCBI BioProject 收录的人类(Homo sapiens)项目,编号 203204,英文名称为“PRJNA203204: IkB-like protein NFKBIZ regulates NF-kB signaling and is critical for survival of ABC DLBCL (NFKBIZ inhibition)”。项目聚焦 IkB 样蛋白 NFKBIZ 对 NF-kB 信号的调控,以及其对 ABC DLBCL 生存的关键作用,并涉及 NFKBIZ 抑制条件。从主题标签看,该项目属于转录组或基因表达范畴,本站将其归类为肿瘤 / 淋巴瘤方向。整体而言,该项目围绕 NFKBIZ 在 ABC DLBCL 中的功能与信号调控展开,适合关注 NF-kB 信号通路、ABC DLBCL 生存机制及 NFKBIZ 抑制相关研究的人员参考。

【数据集背景】

该项目来源于 NCBI BioProject,源站标题为“Homo sapiens (ID 203204) - BioProject - NCBI”。BioProject 是围绕单一研究计划组织起来的生物数据集合,通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口,用于查找该项目所产生的多种数据类型。该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据与转录组或基因表达相关。项目名称直接指向 IkB 样蛋白 NFKBIZ 对 NF-kB 信号的调控,以及 NFKBIZ 对 ABC DLBCL 生存的关键作用,并明确涉及 NFKBIZ 抑制条件。

【数据内容】

该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明其数据内容属于转录组或基因表达类型。项目名称涉及 NFKBIZ 抑制条件,并围绕 NFKBIZ 调控 NF-kB 信号及其对 ABC DLBCL 生存的关键作用展开。除上述信息外,源站未提供更具体的数据内容说明,例如样本数量、测序平台、表达矩阵或差异分析结果等。

【采集与来源】

该项目来自 NCBI BioProject,源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 203204,物种为 Homo sapiens。BioProject 记录本身是相关生物数据的集合入口,用于汇集由单一研究计划产生的多种数据类型。关于样本采集地点、采集时间、实验处理细节及具体机构信息,源站未提供。

【适用场景】

该项目适用于与转录组或基因表达相关的研究场景,尤其是围绕 NF-kB 信号调控、IkB 样蛋白 NFKBIZ 功能、ABC DLBCL 生存机制以及 NFKBIZ 抑制条件的研究。由于本站分类为肿瘤 / 淋巴瘤,该项目也可作为淋巴瘤相关研究中的参考数据资源。具体分析场景、可支持的假设或可复现的研究问题,源站未提供。

【使用方法】

该项目可通过 NCBI BioProject 记录进行访问,用户可借助 BioProject 提供的统一入口查找与该项目相关的多种数据类型。关于数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具要求,源站未提供。

【质量与限制】

该项目为 NCBI BioProject 收录记录,其描述强调 BioProject 作为单一研究计划相关生物数据的集合入口。关于数据质量指标、覆盖度、批次效应、样本代表性或使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

关于该项目的引用方式与许可条款,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA203204

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

核因子-κB(NF-κB)通路的组成性激活是弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)活化B细胞样(ABC)亚型的标志。已发现导致该致癌通路组成性活化的NF-κB调控因子的反复突变。然而,特定靶基因如何被调控仍不清楚。我们发现,与GCB DLBCL原发患者样本相比,结合NF-κB亚基并增强某些NF-κB靶基因反式激活同时抑制其他靶基因的IκB样蛋白NFKBIZ在ABC中表达上调(p=5.1 x 10^-37)。通过RNA干扰敲低NFKBIZ对ABC DLBCL细胞系具有毒性,但对GCB DLBCL细胞系无毒性。NFKBIZ敲低后的基因表达谱分析显示大量NF-κB靶基因显著下调,表明其在调控NF-κB信号传导中发挥核心作用。为进一步探究NFKBIZ在ABC DLBCL中介导NF-κB信号传导的分子机制,我们进行了免疫沉淀实验,检测到NFKBIZ与p50和p52 NF-κB亚基均存在相互作用,表明经典和非经典NF-κB通路均受NFKBIZ调控。

总体而言,我们的数据表明NFKBIZ是ABC DLBCL中NF-kB信号传导所必需的,因此可能成为未来治疗的一个有前景的分子靶点。完整数据集包含三项实验,均使用雄性HBL-1 ABC DLBCL细胞系:a) 通过shRNA抑制NFKBIZ后的8组配对GEP测量,b) 应用MLN抑制剂后的6组配对GEP测量,c) 应用MALT抑制剂后的4组双色测量。总体设计:该数据集包括通过shRNA抑制NFKBIZ后的8组配对GEP测量。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案