成人MYC阳性成熟B细胞淋巴瘤（非分子伯基特淋巴瘤）生物学特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA188795

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MYC易位是伯基特淋巴瘤的生物学标志，但也见于其他成熟B细胞淋巴瘤。如果伴有靶向BCL2和/或BCL6癌基因的染色体断裂，这些MYC易位阳性(MYC+)淋巴瘤被称为双打击淋巴瘤(DHL)；否则，则称为单打击淋巴瘤(SHL)。为了表征这些非伯基特淋巴瘤的MYC+淋巴瘤的生物学特征，我们在排除经基因表达谱(GEP)定义的分子伯基特淋巴瘤(mBL)后，探索了80例MYC易位(MYC+)淋巴瘤(31例SHL、26例BCL2+/MYC+、14例BCL6+/MYC+、6例BCL2+/BCL6+/MYC+和3例BCL6状态未知的MYC+淋巴瘤)的分子、病理和临床方面。SHL与DHL的比较显示，MYC伴侣(IG/非IG)频率、基因组复杂性或MYC表达均无差异，GEP也无差异。DHL显示更频繁的GCB样GEP以及更高的IGH和MYC突变率。GEP揭示BCL6+/MYC+与BCL2+/MYC+ DHL之间有130个差异表达基因。BCL2+/MYC+ DHL显示更频繁的GCB样GEP。

根据MYC伴侣（IG/非IG）对所有淋巴瘤进行分析，未发现实质性差异。与mBL和无MYC断裂的淋巴瘤相比，SHL和DHL患者具有相似的较差预后。我们的数据表明，在排除mBL后，MYC+淋巴瘤在生物学上可以广泛归为一类，无需进一步细分。总体设计：将32份弥漫性大B细胞淋巴瘤样本与HG-U133A Affymetrix GeneChips进行杂交。此外，本研究还包含30份已发表样本，这些样本贡献于GSE4475（Hummel等，2006年（PMID 16760442）），以及来自GSE22470的18份已发表样本（Salaverria等，2011年（PMID 21487109））。未对已发表样本进行重新标准化。完整数据集代表：（1）32份弥漫性大B细胞淋巴瘤样本，（2）来自GSE4475的30份样本，以及（3）来自GSE的18份样本

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。