人类骨髓与脂肪组织来源基质细胞的分子谱分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA102389

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

迄今为止，骨髓（BM）一直被视为基质细胞（SC）——最初被称为间充质干细胞——的参考来源。近期有报道指出，成人脂肪组织（AT）也是分离具有间充质样表型细胞的宝贵来源。尽管骨髓和脂肪组织来源的基质细胞（BMSC和ATSC）具有相似的免疫表型，并在体外展现出多向分化潜能，但关于特异性标志物的共识性面板仍存争议，且调控其分化命运的确切分子机制尚未完全明了。本研究旨在比较从AT和BM中分离的基质细胞的基因组范围表达谱，并强调MSC干性特性的核心。此外，我们聚焦于ATSC的分子特征，试图揭示其特异性特点。我们鉴定出一个由ATSC和BMSC共同调控的190个基因的重叠数据集。在此基础上，我们能够归类出6个关键的生物学家族，这些可被视为一种干性签名，构成了自我更新潜力及生成祖细胞能力的基础。

尤其值得注意的是，本研究揭示了信号通路以及众多转录调节因子表达所发挥的关键作用。在ATSC中特异性受调控的基因表明，这些细胞具有抗氧化和神经保护特性。综上所述，这些结果为理解MSC维持的分子基础提供了新的线索，并表明ATSC具有有趣的特性，可能对若干潜在的临床应用有用。关键词：基因组图谱 总体设计：骨髓和脂肪组织样本分别取自四名长期无病的霍奇金淋巴瘤患者（随访调查期间）和四名接受部分腹壁成形术的患者。此外，本研究还使用了一种细胞系（MRC-5细胞）作为对照，以排除参与稳态的基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。