系统性滤泡性淋巴瘤 OncoScan SNP 数据集

资源简介

系统性滤泡性淋巴瘤 OncoScan SNP 数据集

该数据集收录了 122 例系统性滤泡性淋巴瘤（systemic follicular lymphoma, sFL）患者的初始肿瘤样本，全部为 FFPE（福尔马林固定石蜡包埋）样本，采用 OncoScan SNP 微阵列进行检测，数据文件类型为 Affymetrix CEL 强度数据。数据集英文名称为 OncoScan SNP data set for systemic follicular lymphoma (sFL)，来源于 ega-archive.org，在分类上归属于肿瘤 / 淋巴瘤方向。该数据集聚焦于系统性滤泡性淋巴瘤这一特定淋巴瘤亚型的基因组变异检测，以 SNP 微阵列产生的强度数据形式提供，可为研究者开展该疾病相关的基因组分析提供样本层面的数据基础。

【数据集背景】

系统性滤泡性淋巴瘤是淋巴瘤中的一种亚型，针对该类肿瘤样本开展基因组层面的检测有助于刻画其分子特征。该数据集以 sFL 患者为对象，采集其初始肿瘤样本并借助 OncoScan SNP 微阵列完成检测，形成了一套以样本为单位、以微阵列强度数据为载体的数据集合。数据集在站点分类中归入肿瘤 / 淋巴瘤，主题标签方面源站未提供。

【数据内容】

数据集包含 122 例 sFL 患者的初始肿瘤样本数据，样本均为 FFPE 样本，且为未配对（unpaired）的初始肿瘤样本。检测平台为 OncoScan SNP 微阵列，数据文件类型为 Affymetrix CEL 强度数据文件（Thermo Fisher Scientific, Waltham, Massachusetts, USA）。CEL 文件是微阵列实验产生的原始强度数据文件，记录了探针水平的信号强度信息，是后续进行基因型判定、拷贝数分析等处理的原始输入。除上述样本数量、样本类型、检测平台与文件类型外，源站未提供关于数据文件数量、单个文件大小、总数据量、样本临床信息字段等更细化的描述。

【采集与来源】

该数据集来源于 ega-archive.org。样本为 sFL 患者的初始肿瘤样本，共 122 例，均以 FFPE 形式保存并用于 OncoScan SNP 微阵列检测。检测所使用微阵列产品与试剂来自 Thermo Fisher Scientific（Waltham, Massachusetts, USA）。关于样本采集机构、采集时间范围、伦理审批信息以及数据提交者等具体来源细节，源站未提供。

【适用场景】

基于其内容构成，该数据集适用于围绕系统性滤泡性淋巴瘤的基因组变异研究，例如利用 SNP 微阵列强度数据开展拷贝数变异、杂合性缺失等基因组改变的分析，也可用于以 FFPE 样本为对象的微阵列数据处理方法学研究与验证。由于样本为初始肿瘤样本，可用于考察肿瘤初始阶段的基因组特征。需要说明的是，上述适用方向系依据数据类型的通用用途组织，源站未提供该数据集的具体研究结论或应用案例。

【使用方法】

使用该数据集时，通常以 Affymetrix CEL 强度数据文件为起点，借助支持 OncoScan SNP 微阵列数据的分析软件完成探针信号读取、标准化、基因型判定与拷贝数分析等步骤。由于样本为 FFPE 来源，分析过程中需考虑该类样本核酸质量对信号的影响。关于数据获取方式、访问权限申请流程、是否提供配套分析流程或元数据表格，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的样本均为 FFPE 样本，且为未配对的初始肿瘤样本，未包含配对正常样本的信息，源站亦未提供样本核酸质量、微阵列质控指标、数据完整性等质量相关信息。数据集仅包含 122 例样本，样本规模有限。关于数据是否存在缺失、质控是否通过、批次信息等，源站未提供。使用者在分析时应自行评估数据质量并谨慎解释结果。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、发表文献、许可协议与使用条款，源站未提供。使用者在获取与使用数据前，应向数据来源站点 ega-archive.org 查询相关的访问政策与引用要求。