弥漫大B细胞淋巴瘤患者EBV感染检测与流行率原始数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.18150/pd6jkl

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该科学活动的目的是应用敏感的分子生物学方法，检测和定量弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者生物样本中的Epstein–Barr病毒（EBV）遗传物质。项目产生的原始数据已存储，包括：(i) 使用微滴式数字PCR（ddPCR）对淋巴瘤患者样本中的EBV DNA和RNA进行定量检测的原始数据，靶向EBV基因组的BamHI-W片段，同时检测人类参考基因RPP30。数据集还包括检测EBER1、LMP1和EBNA2病毒mRNA转录本的ddPCR结果，与人类参考基因GAPDH一同分析。存储的数据包括ddPCR平台生成的输出数据；(ii) 使用原位杂交（EBER-ISH）获得的DLBCL和霍奇金淋巴瘤（HL）患者肿瘤组织中病毒EBER1/2转录本检测的显微图像记录。

该数据集包含原始显微镜PNG图像；(iii) 使用QIAxcel系统通过自动毛细管电泳获得的淋巴瘤患者样本中EBV EBNA2和LMP1基因扩增片段的可视化图像。所存文件包括显示PCR产物分离及其相应扩增子大小的图形输出（PNG图像）；(iv) 淋巴瘤患者样本中EBV EBNA2和LMP1基因PCR扩增产物Sanger DNA测序的原始色谱图（AB1文件）。色谱图文件可使用例如Technelysium网站提供的免费Chromas软件2.6.6版打开和分析。本研究由波兰国家科学中心（资助号：2024/08/X/NZ7/01767）全额资助。附件文件包含用于分析的原始数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。