ADAR1介导的RNA编辑促进B细胞淋巴瘤发生

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD041549

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目旨在评估ADAR1 RNA编辑对B细胞淋巴瘤发生的贡献，特别是在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的作用。在我们的DLBCL队列中，RNA编辑靶向已知淋巴瘤驱动通路中的转录本，如凋亡、p53和NF-kB信号通路，以及先前未被认识的RIG-I样通路。在后一种情况下，我们显示MAVS转录本中ADAR1介导的编辑与MAVS蛋白表达水平升高相关，并与干扰素/NF-kB信号增强和T细胞耗竭增加相关。为确认这一机制，我们对DLBCL细胞系(RCK8)在存在或不存在ADAR1的条件下进行了LC-MSMS分析(图S11D)。此外，利用靶向RNA碱基编辑工具在ADAR1缺陷细胞中恢复MAVS 3’UTR内的编辑，我们证明，在没有经典核酸受体感应激活的情况下，编辑很可能是下游信号增强的原因。为确认这种信号增强依赖于特定编辑后MAVS蛋白的增加，我们对相同样本进行了LC-MSMS分析(图4G)。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。