两种促癌基质基因表达程序依赖肺功能
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/肺癌领域，围绕慢性阻塞性肺疾病（COPD）作为肺癌独立风险因素的机制展开
基本信息
资源简介
两种促癌基质基因表达程序依赖肺功能
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/肺癌领域，围绕慢性阻塞性肺疾病（COPD）作为肺癌独立风险因素的机制展开。研究采用蛋白质组学与多聚核糖体图谱分析，比较伴有与不伴有肺癌、且 COPD 严重程度不同的患者基质，识别出依赖 COPD 的癌症相关基因表达程序，主要表现为 mRNA 翻译改变。这些程序在轻度 COPD 中位于 mTOR 通路下游，在更严重 COPD 中则与病理性细胞外基质相关，并伴随不同的促癌成纤维细胞分泌组激活。数据可用于探索肺基质促癌起始的分子状态与翻译调控机制（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：慢性阻塞性肺疾病（COPD）是肺癌的独立风险因素，提示 COPD 基质有利于癌症起始。因此，我们使用蛋白质组学和多聚核糖体图谱分析来识别区分携带肺癌患者与未携带肺癌患者基质的基因表达程序，这些患者具有不同的 COPD 严重程度。该分析揭示了不同的依赖 COPD 的癌症相关基因表达程序，主要表现为 mRNA 翻译的改变。在机制上，这些程序在轻度 COPD 中位于哺乳动物雷帕霉素靶蛋白通路下游，在更严重的 COPD 中则位于病理性细胞外基质下游；并且这两个程序与不同的促癌成纤维细胞衍生分泌组的激活平行。因此，根据 COPD 严重程度，肺基质可以处于两种有利于癌症起始的状态，这可能导致不同的疾病
【主题与分类】
主题标签：Human、Translatomics、Copd、Lung tissue、Transcriptomics、Proteomics、Emphysema、Lung cancer。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD007743
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD007743
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
慢性阻塞性肺疾病（COPD）是肺癌的独立危险因素，提示COPD基质有利于癌症的发生。因此，我们采用蛋白质组学和多聚核糖体谱分析技术，旨在识别能够区分伴有肺癌患者与不伴有肺癌患者（且COPD严重程度各异）基质之间的基因表达程序。该分析揭示了以mRNA翻译改变为主要表现形式的、依赖于COPD的独特癌症相关基因表达程序。在机制上，这些程序在轻度COPD中位于哺乳动物雷帕霉素靶蛋白通路的下游，而在更严重的COPD中则位于病理性细胞外基质的下游；且这两种程序均与不同的促癌成纤维细胞来源分泌组的激活相平行。因此，根据COPD严重程度的不同，肺基质可处于两种有利于癌症发生的状态，这可能导致不同的疾病实体。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
