细胞外囊泡蛋白质组学分析鉴定CDCP1为肺癌关键转移相关糖蛋白

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD064331

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数据说明

肺癌是全球最常见的恶性肿瘤，转移导致超过90%的死亡病例。近期研究表明，细胞外囊泡（EVs）和糖蛋白在肿瘤进展中发挥关键作用。本研究比较了95C（低转移性）和95D（高转移性）肺癌细胞来源EVs的糖蛋白质组，以发现转移过程中的关键靶点。通过凝集素亲和层析与定量蛋白质组学联用，共鉴定出1562种糖蛋白。与95C EVs相比，95D EVs中有23种糖蛋白显著上调超过20倍，包括CDCP1、TNC、NCAM2和ITGA4。含CUB结构域蛋白1（CDCP1）在95D EVs中上调143倍，且与TCGA数据库中肺癌患者的不良预后显著相关。随后我们构建了CDCP1敲除（KO）的95D细胞系，发现CDCP1缺失降低了细胞迁移能力，EVs与细胞共培养实验也证实了这一点。我们进一步采用基于Ti4±IMAC的磷酸蛋白质组学分析，研究CDCP1 KO细胞系中信号通路的变化。

共鉴定出147个差异表达的磷酸化蛋白，这些蛋白参与细胞黏附、细胞骨架调控及ErbB信号通路。验证实验证实，作为ErbB信号通路标志物的磷酸化SRC和JUN蛋白水平分别下降了5.5倍和4.2倍，表明CDCP1可通过ErbB信号通路促进细胞迁移。我们的数据表明，糖蛋白CDCP1被选择性包装进细胞外囊泡（EVs）中，并可能促进癌症转移，这使其成为抗转移研究和癌症治疗的关键靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。