PRJNA203381：高侵袭与低侵袭A549人肺腺癌细胞microRNA表达数据
该数据集来自NCBI，包含高侵袭性与低侵袭性A549人肺腺癌细胞亚系的microRNA微阵列表达数据。研究通过连续transwell侵袭实验建立具有相反迁移和侵袭特性的两个NSCLC亚细胞系，并经过七代筛选，每组使用三个重复进行RNA提取和microRNA微阵列检测
基本信息
资源简介
PRJNA203381：高侵袭与低侵袭A549人肺腺癌细胞microRNA表达数据
PRJNA203381 数据集收录了高侵袭性与低侵袭性 A549 人肺腺癌细胞亚系的 microRNA 表达数据。肺癌患者癌症相关死亡的主要原因通常归因于肿瘤向骨、脑、肝和肾上腺等远处器官转移，而 miRNA 表达的失调被认为通过调控靶基因参与转移的启动与进展。该研究利用连续 transwell 侵袭实验建立了迁移与侵袭特性相反的两个非小细胞肺癌（NSCLC）亚细胞系，并通过 miRNA 微阵列获取 miRNA 表达全景，以识别转移过程中的重要参与者。数据集属于肿瘤/肺癌分类，主题标签为转录组或基因表达，来源为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据集背景】
肺癌是癌症相关死亡的主要原因之一，其高死亡率在很大程度上与肿瘤的远处转移能力有关。转移涉及肿瘤细胞从原发灶脱离、迁移、侵袭并定植于骨、脑、肝、肾上腺等远端器官。microRNA 作为一类能够调控靶基因表达的小分子 RNA，其表达失调被认为在肿瘤转移的启动和进展中发挥重要作用。为在体外研究这一过程，研究者需要建立具有可比遗传背景但侵袭能力相反的细胞模型。该数据集正是基于这一需求，从异质性亲本细胞群体中衍生出高侵袭性和低侵袭性 A549 人肺腺癌亚细胞系，并对其 miRNA 表达进行比较分析，以期获得转移相关 miRNA 表达的整体视图并识别关键分子。
【数据内容】
该数据集的核心内容是两组 A549 亚细胞系的 microRNA 微阵列表达数据，分别对应高侵袭性和低侵袭性表型。实验设计为：从异质性亲本群体中建立高、低侵袭性 A549 亚细胞系，经过七代筛选获得稳定亚系；每组使用三个重复进行 RNA 提取和 miRNA 微阵列检测。因此，数据在结构上体现为两种侵袭表型之间的对照比较，并带有生物学重复，可用于评估组间 miRNA 表达的差异。主题标签表明其属于转录组或基因表达范畴。除上述微阵列表达数据及分组、重复信息外，源站未提供关于具体 miRNA 数目、探针平台型号、表达矩阵文件格式等更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），数据集英文名称为“PRJNA203381: MicroRNA expression data from high and low invasive A549 human lung adenocarcinoma cells”。样本材料为人肺腺癌 A549 细胞系衍生出的两个 NSCLC 亚细胞系，二者在迁移和侵袭特性上相反。亚细胞系的建立采用连续 transwell 侵袭实验，从异质性亲本群体出发，经七代筛选获得高侵袭性与低侵袭性亚系。随后对每组三个重复样本进行 RNA 提取，并开展 miRNA 微阵列检测。源站未提供样本采集时间、培养条件细节、微阵列具体平台与试剂信息。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌转移机制相关的转录组研究，尤其是围绕 microRNA 调控网络的分析。典型用途包括：比较高低侵袭性 A549 亚系之间的 miRNA 表达差异，筛选与迁移、侵袭表型相关的候选 miRNA；将差异表达 miRNA 与其预测或已验证的靶基因结合，探索转移启动与进展的调控通路；作为体外细胞模型数据，为后续功能验证实验提供候选分子列表；也可用于方法学上关于细胞亚系建立与微阵列比较设计的学习与参考。由于数据聚焦于 A549 肺腺癌细胞的侵袭表型对比，其适用场景主要限于该细胞模型和 miRNA 表达层面。
【使用方法】
使用时可依据高侵袭性与低侵袭性分组及每组三个重复的结构，对 miRNA 微阵列表达值进行组间差异分析，识别在两种侵袭表型间表达发生变化的 miRNA。分析中应充分利用生物学重复评估变异，注意微阵列数据通常需要的背景校正与归一化处理。差异结果可进一步结合 miRNA 靶基因预测资源进行功能注释，形成候选调控假设。由于源站未提供具体平台与预处理细节，使用前需参考原始数据附带的平台和预处理说明。源站未提供关于数据下载格式、分析脚本或许可条款的具体指引。
【质量与限制】
该研究的实验设计包含七代筛选建立的稳定亚系以及每组三个生物学重复，为组间比较提供了基本的技术与生物学重复保障。但需注意其局限：数据仅来自 A549 这一人肺腺癌细胞系的衍生亚系，属于体外模型，不能直接等同于体内转移过程；研究聚焦 miRNA 微阵列表达层面，源站未提供蛋白质或功能验证数据；微阵列技术的灵敏度与动态范围有限，低丰度 miRNA 可能难以可靠检出。此外，源站未提供关于批次效应、数据质控指标及归一化方法的详细说明，使用者在解释差异结果时应保持谨慎。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，源站未提供具体的引用文献信息与许可条款。使用或再分发数据前，应访问 ncbi.nlm.nih.gov 上该数据集页面核实原始作者、发表文献及数据使用政策。源站未提供其他引用与许可细节。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
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无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA203381
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
肺癌患者癌症相关死亡的主要原因通常归因于其转移至骨、脑、肝和肾上腺等远处器官的能力。miRNA表达失调被认为通过其调控靶基因的能力促进转移的发生和进展。本研究采用连续transwell侵袭实验建立了具有相反迁移和侵袭特性的两种NSCLC亚细胞系，随后通过miRNA微阵列获取miRNA表达概况并鉴定转移过程中的重要参与者。总体设计：从异质性亲本群体中建立高侵袭性和低侵袭性A549亚细胞系，并经过七代筛选。使用三个重复进行RNA提取和miRNA微阵列分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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