P-Lip与P1C-Lip处理小鼠A549异种移植瘤的RNA-seq

该数据集为BioProject(ID 1531005)收录的RNA-seq数据,来源于经紫杉醇脂质体(P-Lip)或等摩尔紫杉醇-塞来昔布脂质体(P1C-Lip)处理的小鼠A549异种移植瘤

sra
浏览 6
基因组回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA1531005: RNA-seq of A549 xenograft tumors from mice treated with paclitaxel liposomes (P-Lip) or equimolar paclitaxel-celecoxib liposomes (P1C-Lip)

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

P-Lip与P1C-Lip处理小鼠A549异种移植瘤的RNA-seq

该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA-seq 数据,项目编号为 PRJNA1531005,全称为“RNA-seq of A549 xenograft tumors from mice treated with paclitaxel liposomes (P-Lip) or equimolar paclitaxel-celecoxib liposomes (P1C-Lip)”。其研究对象为小鼠体内的 A549 异种移植瘤,比较了紫杉醇脂质体(P-Lip)与等摩尔紫杉醇-塞来昔布脂质体(P1C-Lip)两种处理条件下的转录组基因表达情况。数据主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,在分类上归属于肿瘤 / 肺癌方向,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言,该数据集围绕肺癌异种移植模型的药物处理转录组响应展开,可用于观察不同脂质体给药方案对肿瘤基因表达谱的影响。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一项单一研究计划而汇集生物数据的集合,这些数据源自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口,用以查找该项目所产生的多种数据类型及其相关链接。本数据集对应的研究计划聚焦于小鼠 A549 异种移植瘤在两种脂质体药物处理下的 RNA-seq 分析,属于肿瘤学与肺癌研究背景下的转录组数据。

【数据内容】

该数据集的核心内容为 RNA-seq 数据,来源于经紫杉醇脂质体(P-Lip)或等摩尔紫杉醇-塞来昔布脂质体(P1C-Lip)处理的小鼠 A549 异种移植瘤。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明数据主要涉及转录组或基因表达层面。数据在分类上归入肿瘤 / 肺癌。除上述信息外,关于样本数量、测序深度、读长、表达矩阵或差异基因列表等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 PRJNA1531005。研究对象为小鼠 A549 异种移植瘤,处理条件包括紫杉醇脂质体(P-Lip)与等摩尔紫杉醇-塞来昔布脂质体(P1C-Lip)。关于实验动物品系、给药剂量、给药周期、样本采集时间点、测序平台及建库方法等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与肺癌异种移植模型相关的转录组或基因表达研究场景,尤其是涉及紫杉醇脂质体与紫杉醇-塞来昔布脂质体处理比较的分析。可用于探索两种处理条件下肿瘤基因表达谱的差异,或作为肿瘤 / 肺癌方向转录组研究的参考数据。关于更具体的适用分析类型、统计方法或临床转化场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录形式提供,用户可通过 BioProject 记录查找该项目所产生的多种数据类型及其链接。关于数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具等具体使用指引,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 收录的 RNA-seq 数据,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。关于数据质量指标、测序深度、重复数、批次效应、数据完整性或已知技术限制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 PRJNA1531005。关于引用方式、许可条款或使用限制等信息,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1531005

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

紫杉醇和塞来昔布在非小细胞肺癌中表现出比例依赖性协同作用,在等摩尔比时协同作用最大(联合指数0.44),而在1:500摩尔比时完全消失。为明确这种协同作用的分子基础,对皮下A549异种移植瘤进行了转录组测序。比较P1C-Lip组和P-Lip组,鉴定出821个差异表达基因(446个上调,375个下调)。KEGG分析显示,MAPK信号通路富集最显著。单用紫杉醇上调了MAPK负调控因子DUSP5和DUSP7以及前列腺素合成酶PTGS2和PTGES,而等摩尔塞来昔布抑制了这些基因,上调了促凋亡介质FAS、CASP3和CASP8,并下调了Survivin和Vimentin。这些数据表明,这种协同作用源于对紫杉醇诱导的COX-2/PGE2/MAPK代偿性生存轴的消除。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案