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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

肺神经内分泌癌经血清素诱导免疫抑制巨噬细胞驱动对T细胞衔接器tarlatamab耐药 [TIL]

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1527148），英文名称为“Lung neuroendocrine cancer induces immunosuppressive macrophages via serotonin to drive resistance to the T cell engager tarlatamab [TIL]”。其研究主题聚焦于肺神经内分泌癌如何通过血清素诱导免疫抑制性巨噬细胞，并由此驱动肿瘤对 T 细胞衔接器 tarlatamab 的耐药。样本类型标注为 TIL，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类归入肿瘤 / 肺癌。该数据集为研究者提供了一个集中获取与该项目相关多种数据类型链接的入口，便于围绕肺神经内分泌癌免疫微环境、血清素信号通路、巨噬细胞免疫抑制功能以及 T 细胞衔接器耐药机制等方向开展转录组或基因表达层面的探索。

【数据集背景】

肺神经内分泌癌是一类具有独特生物学行为的肿瘤，其与免疫治疗之间的关系日益受到关注。T 细胞衔接器 tarlatamab 作为一类旨在连接 T 细胞与肿瘤细胞、从而激活抗肿瘤免疫应答的治疗策略，在临床应用中可能面临耐药问题。该数据集所对应的 BioProject 项目，正是围绕“肺神经内分泌癌通过血清素诱导免疫抑制巨噬细胞，进而驱动对 tarlatamab 的耐药”这一科学问题展开。项目以 TIL 为样本类型，结合转录组或基因表达主题标签，试图从基因表达层面揭示肿瘤微环境中免疫抑制性巨噬细胞的形成机制及其与耐药表型之间的关联。BioProject 作为生物数据的集合，来源于单一组织或联盟，旨在为同一研究计划下产生的多样化数据类型提供统一检索入口。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容主要涉及转录组或基因表达相关信息。样本类型标注为 TIL，即肿瘤浸润淋巴细胞。项目名称中同时提及肺神经内分泌癌、血清素、免疫抑制巨噬细胞、T 细胞衔接器 tarlatamab 以及耐药等关键要素，说明数据内容可能围绕这些生物学过程或治疗抵抗机制展开。然而，关于具体的数据文件类型、基因列表、表达矩阵、测序平台、样本数量、分组设计、时间点或处理条件等细节，源站未提供。因此，无法进一步描述数据集中包含哪些具体的转录组数据形式或基因表达分析结果。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示为“Lung neuroendocrine cancer induces immunosuppressi... (ID 1527148) - BioProject - NCBI”。BioProject 记录本身是生物数据的集合，来源于单一组织或联盟，并为用户提供查找同一项目下多种数据类型的统一入口。该数据集的英文名称中包含“[TIL]”，提示样本类型为肿瘤浸润淋巴细胞。关于样本采集的具体地点、时间、人群特征、伦理审批信息、测序或实验方法、试剂来源、仪器型号等采集与来源细节，源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于与肺神经内分泌癌相关的肿瘤免疫学、转录组学或基因表达研究。具体而言，可能适用于探索血清素在肿瘤微环境中对巨噬细胞免疫抑制功能的调控作用，分析 T 细胞衔接器 tarlatamab 耐药机制，以及研究肿瘤浸润淋巴细胞在耐药过程中的角色。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，该数据集也可用于基因表达差异分析、通路富集分析或免疫微环境相关基因表达特征挖掘等场景。但需注意，以上适用方向均基于项目标题和主题标签所提示的研究主题，具体分析可行性取决于数据集中实际包含的数据类型和内容，而后者源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库进行访问，项目 ID 为 1527148。BioProject 记录为用户提供单一入口，以查找链接到该项目的多种数据类型。用户可根据源站提供的链接进一步获取相关数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具、参数设置或代码示例等使用方法细节，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共生物数据资源。其质量与限制取决于源站所收录数据的完整性、准确性以及更新状态。当前可获取的信息仅包括项目名称、主题标签、样本类型标注和分类信息，缺乏对数据质量指标、批次效应、测序深度、覆盖度、重复性、验证实验或统计功效等方面的描述。因此，无法对该数据集的质量进行具体评估。此外，由于源站未提供样本量、实验设计、数据预处理方式等关键信息，使用者在解释结果时需谨慎，并应结合源站原始记录进行核实。

【引用与许可】

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE346914

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1527148

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Tarlatamab是一种靶向DLL3/CD3的T细胞衔接器（TCE），对小细胞肺癌（SCLC）具有临床疗效，尽管其疗效仍然有限，这提示阐明其耐药机制的重要性。在此，我们表明，由DLL3高表达神经内分泌癌（NEC）产生的5-羟色胺（5-HT）可诱导免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞（TAM），从而导致CD8+ T细胞功能受损和TCE耐药。利用SCLC和大细胞神经内分泌癌（LCNEC）患者队列，我们发现DLL3高表达SCLC在肿瘤微环境中诱导免疫抑制性TAM，并对tarlatamab产生耐药。DLL3高表达NEC通过TPH1上调增加5-HT产生。NEC来源的5-HT增强了表达5-HT受体7（HTR7）的TAM的免疫抑制活性。对TAM中的HTR7或NEC中的TPH1进行基因消融，可恢复CD8+ T细胞功能，并提高TCE和PD-1阻断的疗效。我们提出，NEC来源的5-HT–HTR7轴驱动免疫抑制性TAM激活和TCE耐药，使其成为提高TCE疗效的关键靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别