帕博利珠单抗联合或不联合伏立诺他一线治疗转移性非小细胞肺癌的随机2期试验

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1511889),对应一项帕博利珠单抗联合或不联合伏立诺他一线治疗转移性非小细胞肺癌的随机2期试验

sra
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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1511889: Pembrolizumab with or without vorinostat in first-line metastatic non-small cell lung cancer: a randomized phase 2 trial

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

帕博利珠单抗联合或不联合伏立诺他一线治疗转移性非小细胞肺癌的随机2期试验

该数据集对应 NCBI BioProject 数据库中编号为 1511889 的项目,其英文标题为“Pembrolizumab with or without vorinostat in first-line metastatic non-small cell lung cancer: a randomized phase 2 trial”。从标题可以看出,该项目关联的是一项随机 2 期临床试验,研究对象为一线治疗的转移性非小细胞肺癌患者,干预方案为帕博利珠单抗联合或不联合伏立诺他。数据集在分类上归属于肿瘤与肺癌方向,主题标签为转录组或基因表达。作为 BioProject 体系中的一项记录,它汇集了与这一研究计划相关的生物数据,为用户提供统一入口以定位该项目所产生的多种数据类型。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究聚焦于转移性非小细胞肺癌的一线治疗。非小细胞肺癌是肺癌中最常见的类型之一,而转移性阶段的治疗选择与疗效评估一直是临床研究的重点。该试验采用随机 2 期设计,比较帕博利珠单抗单药与帕博利珠单抗联合伏立诺他两种方案。帕博利珠单抗属于免疫检查点抑制剂,伏立诺他则是一种组蛋白去乙酰化酶抑制剂,两者联合的潜在协同效应是该研究关注的方向之一。该 BioProject 记录正是围绕这一临床试验所产生的生物数据而建立,旨在为相关数据提供一个集中、可追溯的索引。

【数据内容】

该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其涉及转录组或基因表达层面的数据。BioProject 记录本身并不直接存储所有原始数据文件,而是作为一项研究计划的汇总入口,链接到由该项目产生的多种数据类型。因此,该数据集的内容核心在于与上述临床试验相关的基因表达或转录组信息,具体的数据文件类型、样本数量、测序平台及分析层级等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是 NCBI 提供的一项资源,用于汇集与某一特定研究计划相关的生物数据。根据源站描述,一个 BioProject 通常源自单一组织或联盟,旨在为用户提供一个统一的位置,以查找该项目所产生的多样化数据类型。该记录编号为 1511889,其标题明确指向帕博利珠单抗联合或不联合伏立诺他治疗转移性非小细胞肺癌的随机 2 期试验。关于样本采集的具体时间、地点、受试者数量及伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与肺癌免疫治疗及表观遗传调控相关的转录组或基因表达研究。研究人员可能利用该数据探索帕博利珠单抗联合伏立诺他方案对基因表达谱的影响,或比较联合治疗与单药治疗之间的转录组差异。此外,该数据也可用于方法学参考,例如在随机 2 期试验背景下整合与分析基因表达数据。由于该记录属于 BioProject 体系,它还可作为查找该研究计划下其他相关数据类型的起点。具体适用的分析类型和下游应用,需结合该项目实际释放的数据内容而定,源站未提供进一步说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以项目编号 1511889 或标题关键词进行检索,访问该记录页面。该页面提供指向该项目所产生的各类数据的链接,用户可据此获取转录组或基因表达相关数据。使用时应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关数据访问规范。关于数据下载格式、分析工具推荐及具体操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该记录为 BioProject 汇总性条目,其本身不包含对数据质量的直接评价。数据的完整性、准确性及可重复性取决于该项目实际提交和公开的数据内容。由于源站未提供样本量、测序深度、数据预处理方法及质控指标等信息,无法对该数据集的质量进行具体评估。此外,该记录仅反映项目层面的描述,不保证所有关联数据均已公开或可直接获取。使用者在解释和利用该数据时,应结合原始研究设计与数据来源进行审慎判断。

【引用与许可】

引用该数据集时,应注明 NCBI BioProject 编号 1511889 及对应标题。关于该数据的具体使用许可、版权声明及引用格式要求,源站未提供。用户在使用前应查阅 NCBI 及 BioProject 的通用条款,并尊重原始数据提交者的权益。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1511889

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对来自一项随机II期临床试验的初治转移性非小细胞肺癌(NSCLC)患者的新鲜冷冻肿瘤活检样本进行了批量RNA测序,该试验比较了帕博利珠单抗单药治疗与帕博利珠单抗联合组蛋白去乙酰化酶抑制剂伏立诺他的疗效。在治疗前及第1周期(第14-21天)获取肿瘤活检样本,以表征与单独PD-1阻断或联合HDAC抑制相关的治疗诱导的转录变化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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