H23肺腺癌细胞经sotorasib与linsitinib单用或联用后的基因表达谱

该数据集为NCBI BioProject(ID 1508685)收录的转录组或基因表达数据,研究对象是H23肺腺癌细胞,处理条件为sotorasib与linsitinib单用或联合使用,用于基因表达谱分析

sra
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基因组回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA1508685: Gene expression profiling of H23 lung adenocarcinoma cells treated with sotorasib and linsitinib alone or in combination

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

H23肺腺癌细胞经sotorasib与linsitinib单用或联用后的基因表达谱

该数据集为 NCBI BioProject 收录的转录组或基因表达数据,项目编号为 1508685,英文名称为“Gene expression profiling of H23 lung adenocarcinoma cells treated with sotorasib and linsitinib alone or in combination”。研究对象是 H23 肺腺癌细胞,处理条件为 sotorasib 与 linsitinib 单用或联合使用,目的在于开展基因表达谱分析。数据主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,本站分类归入肿瘤 / 肺癌。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 BioProject 体系下的生物学数据集合,可用于查找与该项目相关的多种数据类型。

【数据集背景】

该数据集对应的 BioProject 编号为 1508685,标题为“Gene expression profiling of H23 lung adenocarcinoma cells treated with sotorasib and linsitinib alone or in combination”。从标题可知,该项目围绕 H23 肺腺癌细胞展开,关注 sotorasib 与 linsitinib 两种药物在单独使用或联合使用条件下对基因表达的影响。BioProject 是围绕某一项研究计划而组织的生物学数据集合,通常来自单一机构或联合体,并为用户提供统一入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其核心数据属于转录组或基因表达范畴。本站将其分类为肿瘤 / 肺癌,提示其研究对象与肺癌相关。

【数据内容】

该数据集的内容为基因表达谱数据,研究对象是 H23 肺腺癌细胞。处理条件包括 sotorasib 与 linsitinib 单用或联合使用。主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明数据属于转录组或基因表达类型。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表、具体分析结果等更详细的数据内容描述。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Gene expression profiling of H23 lung adenocarcino... (ID 1508685) - BioProject - NCBI”。其来源站为 NCBI,记录类型为 BioProject。源站描述指出,BioProject 是围绕单一研究计划而组织的生物学数据集合,来自单一机构或联合体,并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一位置。除这些来源信息外,源站未提供关于具体采集方法、实验设计、样本处理流程、测序或检测平台等细节。

【适用场景】

该数据集适用于与 H23 肺腺癌细胞、sotorasib 和 linsitinib 单用或联合处理相关的基因表达谱分析场景。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,其潜在用途包括转录组层面的基因表达研究。本站分类为肿瘤 / 肺癌,因此也可用于肺癌相关研究背景下的数据查找与参考。除上述范围外,源站未提供关于具体适用分析类型、研究目标或应用方向的进一步说明。

【使用方法】

该数据集为 NCBI BioProject 记录,用户可通过 NCBI 网站访问该项目页面,并借助 BioProject 记录查找与该项目相关的多种数据类型。源站描述强调,BioProject 记录为用户提供单一入口,以便定位该项目产生的不同数据。除这一访问方式外,源站未提供关于数据下载、预处理、分析流程或软件工具的具体说明。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号为 1508685,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。源站未提供关于数据质量、完整性、批次效应、样本量、重复数、统计功效或技术偏差等方面的具体信息。因此,无法依据现有信息对该数据集的质量与限制做出进一步判断。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的具体引用方式与许可条款。用户如需引用或使用,应访问 NCBI BioProject 对应页面,以源站提供的引用与许可信息为准。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1508685

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

KRAS G12C抑制剂改善了KRAS G12C突变肺癌的治疗;然而,适应性耐药限制了其长期疗效。为了探究联合抑制KRAS和IGF1R的转录效应,我们对KRAS G12C突变肺腺癌细胞系H23进行了RNA测序,分别在使用sotorasib、linsitinib或二者联合处理后。该数据集提供了与单药及联合治疗相关的全基因组基因表达谱,可能有助于识别联合抑制KRAS和IGF1R增强抗肿瘤效果的分子机制。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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