GPX3 通过 HSPB1 泛素化与 Hippo 通路激活抑制肺腺癌进展
数据围绕肺腺癌进展相关基因表达与通路机制，可用于转录组或基因表达层面的分析，帮助研究 GPX3、HSPB1 及 Hippo 通路在肺腺癌中的调控关系与潜在机制（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
GPX3 通过 HSPB1 泛素化与 Hippo 通路激活抑制肺腺癌进展
PRJNA1504946 是一个围绕肺腺癌进展机制建立的生物项目数据集，其英文全称为“GPX3 suppresses lung adenocarcinoma progression through HSPB1 ubiquitination and Hippo pathway activation”。从标题可以看出，该数据集聚焦于 GPX3 在肺腺癌中的抑制作用，并涉及 HSPB1 泛素化以及 Hippo 通路激活等分子机制。数据集在分类上归属于肿瘤／肺癌方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容与转录组或基因表达层面密切相关。整体而言，该数据集可用于探索肺腺癌进展过程中基因表达变化与信号通路调控之间的关系，为研究 GPX3、HSPB1 及 Hippo 通路在肺腺癌中的潜在作用提供数据基础。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，记录编号为 1504946。BioProject 是围绕某一项研究计划或项目而汇集多种生物数据的集合，通常由单一机构或联盟发起。一个 BioProject 记录为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的不同类型数据。该数据集所对应的项目主题为肺腺癌进展机制，核心关注 GPX3 对肺腺癌进展的抑制作用，以及这一过程与 HSPB1 泛素化和 Hippo 通路激活之间的关联。本站将其归类为肿瘤／肺癌，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明该项目的实验或数据产出主要涉及转录组或基因表达检测。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。结合项目标题，数据围绕肺腺癌进展相关基因表达与通路机制展开，可用于转录组或基因表达层面的分析，帮助研究 GPX3、HSPB1 及 Hippo 通路在肺腺癌中的调控关系与潜在机制。关于具体的样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表、通路富集结果等详细内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 数据库。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录，来源于单一组织或联盟，并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。该数据集的英文名称为“PRJNA1504946: GPX3 suppresses lung adenocarcinoma progression through HSPB1 ubiquitination and Hippo pathway activation”，源站标题为“GPX3 suppresses lung adenocarcinoma progression th... (ID 1504946) - BioProject - NCBI”。关于具体的采集方法、实验设计、样本处理流程、测序或检测平台等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤尤其是肺癌相关的基础研究场景，特别是肺腺癌进展机制研究。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，其可用于转录组或基因表达层面的分析，帮助研究者探索 GPX3、HSPB1 及 Hippo 通路在肺腺癌中的调控关系与潜在机制。潜在应用包括：基因表达差异分析、通路机制探讨、分子调控关系研究等。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发、预后评估等具体应用，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库进行访问，记录编号为 1504946。用户可通过 BioProject 记录查找该项目所关联的多种数据类型。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具建议等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开数据库记录。关于数据质量、样本量、测序深度、覆盖度、重复性、批次效应、验证实验等具体质量指标，源站未提供。使用时应结合项目标题和主题标签所指示的范围进行判断，并注意该数据集可能仅涵盖转录组或基因表达层面的信息，其他类型数据是否包含尚不明确。关于数据限制、偏差、适用范围等，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，记录编号为 1504946。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制、数据共享政策等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1504946
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
肺腺癌（LUAD）是肺癌最常见的亚型，然而其预后仍然较差，潜在的分子机制尚未完全阐明。本研究基于锰代谢相关基因构建了一个预后模型，该模型能有效区分不同预后和药物敏感性的LUAD患者。孟德尔随机化分析确定谷胱甘肽过氧化物酶3（GPX3）为关键预后基因，其在LUAD中表达下调，并与良好预后显著相关。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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