C2C12肺癌相关疲劳细胞模型经elesclomol与sorafenib处理的RNA-seq图谱
该数据集为BioProject收录的RNA-seq表达谱数据,针对C2C12肺癌相关疲劳细胞模型,分别经elesclomol与sorafenib处理

基本信息
资源简介
C2C12肺癌相关疲劳细胞模型经elesclomol与sorafenib处理的RNA-seq图谱
PRJNA1490235 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的 RNA-seq 表达谱项目,全称为 RNA-seq profiling of C2C12 lung cancer-related fatigue cellular models treated with elesclomol and sorafenib。该项目围绕 C2C12 肺癌相关疲劳细胞模型展开,分别使用 elesclomol 与 sorafenib 两种药物进行处理,并通过 RNA-seq 技术获取转录组层面的基因表达信息。从分类上看,该数据集归属于肿瘤/肺癌方向,主题标签为转录组或基因表达。BioProject 作为生物数据的集合性记录,将同一项目下产生的多种数据类型汇聚于一处,便于用户集中查找与访问。该数据集适合关注肺癌相关疲劳机制、细胞模型转录组响应以及药物处理效应的研究人员参考使用。
【数据集背景】
肺癌患者在病程中常伴随疲劳等全身性表现,相关机制研究需要在细胞层面建立可操作的模型。C2C12 是一种常用的细胞模型,本项目将其用于构建肺癌相关疲劳的细胞模型,并在此基础上引入 elesclomol 与 sorafenib 两种处理条件,以观察药物干预后细胞转录组的变化。该数据集由 NCBI BioProject 收录,属于肿瘤/肺癌分类下的转录组或基因表达主题数据。BioProject 的设计目标是把源自同一组织或同一计划的生物学数据集中呈现,使用户能够从一个入口找到该项目产生的各类数据链接。因此,PRJNA1490235 可作为该研究方向中转录组表达谱数据的统一访问入口。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 RNA-seq 表达谱数据,研究对象为 C2C12 肺癌相关疲劳细胞模型,处理条件包括 elesclomol 处理和 sorafenib 处理。数据主题标签为 Transcriptome or Gene expression,表明其内容聚焦于转录组层面的基因表达信息。关于样本数量、测序平台、读长、重复数、具体表达矩阵或差异表达结果等细节,源站未提供。除 RNA-seq 表达谱外,该项目是否包含其他类型的数据,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,以 BioProject 形式组织,项目编号为 1490235,英文名称为 PRJNA1490235: RNA-seq profiling of C2C12 lung cancer-related fatigue cellular models treated with elesclomol and sorafenib。源站对 BioProject 的说明指出,BioProject 是围绕单一计划、来自单一组织或联盟的生物学数据集合,并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一位置。关于样本采集的具体地点、时间、操作流程、伦理审批信息以及测序服务的提供方等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于转录组或基因表达相关的研究场景,尤其是围绕 C2C12 肺癌相关疲劳细胞模型在 elesclomol 与 sorafenib 处理下的表达谱分析。潜在用途包括:比较不同药物处理条件下细胞模型的基因表达特征,筛选与药物响应相关的候选基因或通路,以及为肺癌相关疲劳的细胞机制研究提供转录组层面的参考数据。此外,该数据集也可作为肿瘤/肺癌分类下转录组数据的检索对象,供需要查找 BioProject 收录项目的用户使用。关于具体的分析目标或已验证的应用结论,源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以项目编号 1490235 或名称 PRJNA1490235 进行检索,进入该项目的记录页面。BioProject 记录提供指向该项目所产生各类数据的链接,用户可据此定位到相应的 RNA-seq 表达谱数据。关于数据下载的具体格式、文件组织方式、是否提供原始测序读长或表达定量结果,以及配套的分析流程或代码,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集以 BioProject 记录形式发布,其质量相关信息如测序深度、重复一致性、数据完整性评估等,源站未提供。使用时应注意到,该数据基于 C2C12 细胞模型,属于体外实验体系,不能直接等同于临床患者或体内情况。此外,关于批次效应、处理浓度、处理时长等可能影响结果解释的实验条件,源站未提供。因此,在将数据用于比较或推断时,需结合源站记录页面的最新信息进行核实。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 1490235。关于该数据集的引用方式、许可条款或使用限制,源站未提供。用户在使用或再分发数据前,应查阅 NCBI BioProject 记录页面及相关数据仓库的通用政策,以确认适用的引用规范与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1490235
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
这项批量RNA-seq研究分析了在肺癌相关疲劳(LCaRF)细胞模型中,对照条件下以及联合应用埃拉斯克洛和索拉非尼处理后的分化C2C12肌管。该实验旨在识别与铁死亡诱导剂增强的铜离子载体应激、铜死亡相关反应、线粒体功能障碍和氧化还原应激通路相关的转录变化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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