基本信息

模态

医学影像

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

A549肺癌细胞常氧、慢性或瞬时缺氧下碳离子转录响应

该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项转录组研究项目，编号为 1476068，英文名称为“Transcriptional response of A549 lung cancer cells to carbon ions under normoxia, or chronic or transient hypoxia”。项目聚焦于 A549 肺癌细胞在常氧、慢性缺氧或瞬时缺氧条件下接受碳离子照射后的转录响应，属于转录组或基因表达类数据。BioProject 是围绕某一项研究计划汇集生物数据的记录形式，通常来自单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。本站将该数据集归类于肿瘤 / 肺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题中亦包含“Transcriptional response of A549 lung cancer cells... (ID 1476068) - BioProject - NCBI”这一标识信息。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究关注 A549 肺癌细胞在碳离子照射下的转录响应，并比较常氧、慢性缺氧与瞬时缺氧三种条件。碳离子照射属于重离子辐射的一种，在肿瘤放射生物学研究中常被用于探讨辐射类型与氧环境对细胞应答的影响。A549 是肺癌研究中常用的细胞模型。该 BioProject 记录由 NCBI 收录，旨在为相关生物数据提供集中索引。除上述信息外，源站未提供更多关于研究背景、立项动机或实验假设的说明。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其内容属于转录组或基因表达类数据。项目名称明确指向 A549 肺癌细胞在常氧、慢性缺氧或瞬时缺氧条件下对碳离子的转录响应，因此数据内容应围绕上述条件下的基因表达变化展开。BioProject 记录本身是多种数据类型链接的集合入口，用户可通过该记录查找该项目生成的相关数据。关于具体样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表或原始数据文件等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录类型为 BioProject，编号 1476068。BioProject 的定义说明其数据来自单一机构或联合体，并围绕同一研究计划汇集。源站描述仅提供 BioProject 的一般性说明，未给出该项目的具体提交机构、研究团队、样本采集地点或实验实施细节。因此，关于采集与来源的具体信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是涉及肺癌细胞辐射响应、碳离子照射以及常氧与缺氧条件比较的分析。研究人员可将其用于探索不同氧环境下细胞对重离子辐射的转录调控差异，或作为肺癌放射生物学研究中的表达数据参考。由于该记录属于 BioProject 类型，也可用于查找该项目关联的多种数据类型。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 1476068）访问该数据集，并利用 BioProject 提供的统一入口查找该项目生成的不同数据类型。具体的数据下载方式、分析流程、软件工具或参数设置，源站未提供。使用时应结合项目标题所描述的实验条件，即 A549 肺癌细胞、碳离子照射以及常氧、慢性缺氧或瞬时缺氧，来理解数据的组织方式。关于详细的使用步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共数据库收录的项目记录。其质量与限制取决于原始研究的数据提交情况，但源站未提供关于数据质量评估、完整性、批次效应或技术偏差的具体信息。此外，该记录为 BioProject 层面的索引，可能不直接包含所有原始数据或分析结果。关于样本量、重复数、测序深度等可能影响数据质量的因素，源站未提供。

【引用与许可】

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE334632

访问原始数据

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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1476068

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目旨在研究不同氧条件下，碳离子辐射对A549细胞基因表达水平的影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别