PRJNA1473617:B7-H3通过CXCL11/CXCR7/NFIB轴介导SCLC免疫逃逸与转移
该数据集来自 NCBI BioProject(编号 PRJNA1473617),主题为 B7-H3 通过 CXCL11/CXCR7/NFIB 轴介导 SCLC 免疫逃逸与转移,属于肿瘤/肺癌范畴,数据类型为转录组或基因表达

基本信息
资源简介
PRJNA1473617:B7-H3通过CXCL11/CXCR7/NFIB轴介导SCLC免疫逃逸与转移
该数据集为 NCBI BioProject 收录项目,编号 PRJNA1473617,标题为“B7-H3 mediates immune escape and metastasis in SCLC through CXCL11/CXCR7/NFIB axis”。其研究主题聚焦于 B7-H3 通过 CXCL11/CXCR7/NFIB 轴介导小细胞肺癌(SCLC)的免疫逃逸与转移过程,属于肿瘤/肺癌研究范畴。数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据类型与转录组或基因表达相关。该记录来源于 ncbi.nlm.nih.gov,为用户提供访问该项目所生成多种数据类型链接的统一入口。整体而言,该数据集围绕 SCLC 中 B7-H3 相关分子机制展开,适合关注肺癌免疫逃逸、转移机制以及基因表达调控的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号为 PRJNA1473617。其标题明确指向一个具体的研究方向:B7-H3 在 SCLC(小细胞肺癌)中通过 CXCL11/CXCR7/NFIB 轴介导免疫逃逸与转移。BioProject 是 NCBI 提供的一种记录形式,用于汇集与单一研究计划相关的生物数据,这些数据可来自单一组织或联盟。一个 BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,以便找到该项目所产生的多种数据类型链接。该数据集被归类为肿瘤/肺癌领域,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明其核心数据与转录组或基因表达相关。源站未提供该项目的具体研究机构、资助信息或实验设计细节。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容涉及转录组或基因表达层面。项目标题提及 B7-H3、CXCL11、CXCR7 和 NFIB 等分子,并围绕免疫逃逸与转移展开,因此数据可能包含与这些分子及通路相关的基因表达信息。然而,源站未提供具体的样本数量、测序平台、数据文件格式、基因列表或表达矩阵等详细内容。BioProject 记录本身并不直接展示所有原始数据,而是提供指向不同数据类型的链接。因此,该数据集的具体数据内容需通过其关联链接进一步获取。源站未提供关于数据规模、数据组织方式或具体数据文件的说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库。BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的生物数据,这些数据源自单一组织或联盟。该项目的编号为 PRJNA1473617,其标题描述了研究主题。源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、实验操作流程或测序方法等具体采集细节。用户可通过 NCBI BioProject 页面访问该项目,并进一步链接到相关的数据资源。源站未提供关于数据提交者、提交日期或更新历史的详细信息。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤学、肺癌研究,尤其是小细胞肺癌(SCLC)相关领域。其主题涉及 B7-H3 介导的免疫逃逸与转移,以及 CXCL11/CXCR7/NFIB 轴,因此可用于探索这些分子在 SCLC 中的表达变化、调控关系及潜在机制。主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明该数据可用于基因表达分析、转录组水平的研究,例如差异表达分析、通路富集分析或分子互作网络构建。此外,该数据集也可作为肺癌免疫逃逸和转移研究的参考数据,用于验证或比较相关基因表达模式。源站未提供具体的适用分析工具或推荐应用场景。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 页面访问编号 PRJNA1473617 的记录。该记录提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接,用户可据此获取转录组或基因表达相关数据。由于 BioProject 本身是数据链接的集合,具体的数据下载和分析需依赖其关联资源。源站未提供关于数据下载格式、预处理步骤、分析流程或软件工具的说明。用户应根据自身研究需求,结合项目标题和主题标签,判断数据是否适用于其分析目标。源站未提供关于数据使用权限或访问限制的详细信息。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共数据库记录。源站未提供关于数据质量评估、数据完整性、测序深度、覆盖度或错误率等具体指标。由于 BioProject 记录主要提供数据链接,其数据质量取决于关联的原始数据资源。该数据集的限制包括:源站未提供样本量、实验重复数、统计方法或验证实验等信息;此外,项目标题所涉及的具体分子机制尚未在源站描述中展开。用户在使用时应参考关联的原始数据及其质量控制报告。源站未提供关于数据偏差、批次效应或技术限制的说明。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库。源站未提供具体的引用格式、许可协议或使用条款。用户在使用该数据集时,应遵循 NCBI 的一般使用政策,并参考 BioProject 页面提供的引用指南。源站未提供关于数据共享、再分发或商业使用的具体许可信息。建议用户直接访问 NCBI BioProject 页面获取最新的引用和许可要求。源站未提供关于数据所有者的详细信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1473617
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
小细胞肺癌(SCLC)是一种侵袭性恶性肿瘤,通常被认为是免疫荒漠。免疫检查点抑制剂在SCLC中的治疗效果有限,且仅局限于少数患者群体。免疫检查点蛋白B7-H3(也称为CD276)在SCLC中高表达;然而,其对SCLC的功能性贡献尚未被探索。在此,为剖析B7-H3的肿瘤内在功能和免疫调节功能,我们构建了一种新型基因工程小鼠(GEM)模型Rb1fl/fl; Trp53fl/fl; LSL-MycT58A; Cd276fl/fl(RPMC)。Cd276缺失显著损害了原发肿瘤生长、转移播散,并通过增加CD8+ T细胞浸润和减少免疫抑制性髓系细胞群体重编程了SCLC肿瘤微环境。B7-H3的缺失还通过调节抗肿瘤免疫反应改善了对联合治疗(顺铂和抗PD-L1)的响应。在机制上,B7-H3通过CXCL11-CXCR7前馈环路调控NFIB。为进一步评估转化意义,我们测试了靶向B7-H3的抗体药物偶联物m276-SL-PBD,该药物在GEM模型中消除了SCLC。
总体而言,我们的研究结果确立了B7-H3作为SCLC进展、转移能力和免疫逃逸的关键调节因子,并强调了针对B7-H3的疗法作为这一难治性疾病的有前景策略。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
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