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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1471142：肿瘤引流淋巴结中 PLA2G2D 调控抗肿瘤免疫

PRJNA1471142 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录，其英文名称为“PLA2G2D in tumour-draining lymph nodes regulates anti-tumour immunity”。从名称可以看出，该项目围绕肿瘤引流淋巴结中 PLA2G2D 对抗肿瘤免疫的调控作用展开，属于肿瘤学与肺癌研究方向。该记录在 NCBI BioProject 中以编号 1471142 标识，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明项目涉及转录组或基因表达层面的数据。BioProject 作为生物数据的集合入口，将同一项研究计划下产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找与访问。该数据集适合关注肿瘤免疫调控、肺癌相关机制以及基因表达研究的科研人员参考使用。

【数据集背景】

肿瘤引流淋巴结是肿瘤细胞与免疫系统相互作用的重要场所，在抗肿瘤免疫应答的启动与调节中具有关键地位。PLA2G2D 作为一种与免疫调控相关的分子，其在肿瘤引流淋巴结中的作用机制是该项目关注的核心问题。该项目以“PLA2G2D in tumour-draining lymph nodes regulates anti-tumour immunity”为主题，旨在从转录组或基因表达角度探索这一调控关系。本站将该数据集归类于肿瘤与肺癌方向，说明其研究背景与肿瘤免疫及肺部肿瘤密切相关。BioProject 记录本身提供了一个统一入口，使用户能够找到由该项目产生的多种数据类型，从而支持对上述生物学问题的深入探究。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容涉及转录组或基因表达相关信息。项目英文名称明确指向 PLA2G2D 在肿瘤引流淋巴结中对反肿瘤免疫的调控作用，因此数据内容应围绕这一生物学过程展开。BioProject 记录作为生物数据的集合，提供用户查找该项目所生成的不同数据类型链接的单一位置。除上述主题标签与项目名称所反映的信息外，关于具体样本数量、测序平台、表达矩阵或差异基因列表等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1471142。BioProject 是汇集与单一研究计划相关的生物数据的集合，这些数据源自单一组织或联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一的位置，以便查找为该项目生成的各种数据类型。本站将其分类为肿瘤与肺癌方向，并标注主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息以及实验操作流程等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤免疫学、肺癌机制研究以及基因表达分析等方向的科研场景。研究人员可利用该项目探索 PLA2G2D 在肿瘤引流淋巴结中调控抗肿瘤免疫的潜在作用，并结合转录组或基因表达数据开展下游分析。对于关注肿瘤微环境与免疫逃逸机制的研究者，该数据集提供了与肿瘤引流淋巴结相关的基因表达研究入口。此外，该数据集也可用于生物信息学方法开发、差异表达分析或通路富集分析等通用研究用途。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发或特定实验验证等场景，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 1471142 或项目英文名称进行检索，访问该项目的记录页面。BioProject 记录提供用户一个单一位置，以查找为该项目生成的各种数据类型链接。用户可根据页面提供的链接进一步获取转录组或基因表达相关数据。关于具体的数据下载格式、分析工具推荐、参数设置或代码示例等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共生物数据资源。BioProject 作为生物数据的集合，汇集了与单一研究计划相关的多种数据类型。关于该数据集的数据质量评估指标、样本量大小、测序深度、覆盖度、批次效应或验证实验等信息，源站未提供。用户在使用时应结合自身研究需求，对数据的适用性进行独立判断。该数据集在肿瘤与肺癌方向的应用价值，需依据具体研究问题加以评估。

【引用与许可】

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333464

访问原始数据

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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1471142

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目前的癌症免疫疗法可以诱导肿瘤消退，尽管疗效往往不持久。近期研究强调了从肿瘤引流淋巴结（TDLNs）中建立系统性免疫反应的重要性。然而，驱动TDLNs中免疫抑制的机制仍研究不足。我们对黑色素瘤TDLNs应用了空间蛋白质基因组学，并识别出在长期（>5年）疾病控制患者与早期（<2年）疾病复发患者的淋巴结中，免疫细胞组成的区域差异。预后不良患者的TDLNs特征为调节性T细胞（Tregs）、树突状细胞（DCs）和巨噬细胞扩增，并与细胞毒性CD8+ T细胞相互作用。对该空间邻域内细胞类型的靶向转录组学分析揭示了与趋于耗竭的CD8+ T细胞相互作用的免疫调节性髓系细胞表型。除了已知的免疫抑制分子如IDO和PD-L1外，复发疾病患者的副皮质巨噬细胞和DCs在不同癌症类型中均高表达分泌型磷脂酶PLA2G2D。

此外，在对抗PD-1免疫治疗产生获得性耐药的非小细胞肺癌患者中，PLA2G2D表达上调。重要的是，PLA2G2D功能缺失或治疗性抑制显著提高了荷瘤小鼠的生存率，并增强了抗PD-1免疫治疗的疗效。综上所述，我们对癌症患者TDLN进行的深入空间 profiling 提供了对系统性抗肿瘤免疫的新见解，并确定了PLA2G2D作为癌症免疫治疗的靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别