基本信息

模态

基因组

任务类型

回归

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1466516：甘草苷处理对A549细胞转录组表达谱的影响

PRJNA1466516 是一个围绕甘草苷处理 A549 细胞后转录组表达谱展开的公开数据集，英文全称为 Effects of liquiritin treatment on the transcriptome profiling of A549 cells。该数据集归属于肿瘤 / 肺癌分类，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从整体定位看，它记录的是甘草苷干预肺癌细胞后基因表达层面的变化信息，可用于观察药物处理对 A549 细胞转录组的影响，并支持差异表达与表达量分析等研究用途。该数据集的源站标题为 Effects of liquiritin treatment on the transcripto... (ID 1466516) - BioProject - NCBI，说明其在 NCBI 的 BioProject 体系下以项目编号 1466516 进行组织与索引，便于研究者定位和访问相关数据。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一项单一研究计划而汇集生物数据的记录集合，这些数据通常来自一个机构或一个联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种数据类型。PRJNA1466516 正是在这一框架下，围绕甘草苷处理 A549 细胞后的转录组表达谱而建立的项目记录。其研究关注点在于甘草苷对 A549 细胞转录组的影响，属于肿瘤 / 肺癌方向中与基因表达相关的数据资源。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其核心内容属于转录组或基因表达范畴。数据围绕甘草苷处理 A549 细胞后的转录组表达谱展开，可用于研究甘草苷对肺癌细胞基因表达的影响，并支持转录组层面的差异表达与表达量分析等用途。数据集英文名称明确指向“Effects of liquiritin treatment on the transcriptome profiling of A549 cells”，即甘草苷处理对 A549 细胞转录组谱的影响。除上述信息外，关于样本数量、测序平台、具体基因列表、表达矩阵结构等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示其位于 NCBI 的 BioProject 数据库，项目 ID 为 1466516。BioProject 记录本身是生物数据的集合入口，用于链接同一研究计划下产生的多种数据类型。因此，该数据集在来源上属于 NCBI BioProject 所收录的项目记录，而非独立的分析报告或论文附件。关于具体采集单位、研究机构、实验地点、样本处理流程、测序方法及时间信息，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与短描述，该数据集适用于转录组层面的研究场景，尤其是围绕甘草苷对肺癌细胞基因表达影响的探索。具体而言，可用于差异表达分析、表达量分析，以及观察甘草苷处理后 A549 细胞转录组表达谱的变化。对于关注肿瘤 / 肺癌方向、天然产物或药物干预对癌细胞转录组影响的研究者，该数据集可作为相关分析的候选数据资源。关于是否适用于其他癌种、其他细胞系或其他药物处理条件，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录形式发布，用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 1466516 或数据集英文名称进行检索与访问。BioProject 记录提供指向该项目所产生多种数据类型的链接，用户可据此进一步定位相关数据文件。关于具体的下载方式、文件格式、分析流程、软件参数及数据处理步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开数据库中的项目记录。其主题标签明确为 Transcriptome or Gene expression，研究内容指向甘草苷处理 A549 细胞的转录组表达谱。然而，关于数据质量评估指标、测序深度、重复数、批次效应、数据完整性及潜在偏差等信息，源站未提供。因此，在使用该数据集时，研究者需自行评估其是否满足具体分析需求。此外，该数据集仅涉及 A549 细胞与甘草苷处理这一特定条件，外推到其他细胞类型或体内环境时需谨慎。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1466516，英文名称为 PRJNA1466516: Effects of liquiritin treatment on the transcriptome profiling of A549 cells。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制及授权要求，源站未提供。使用者应遵循 NCBI 及 BioProject 数据库的相关政策与通用规范，并在引用时以源站记录为准。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE331009

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1466516

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为探讨甘草苷对非小细胞肺癌的作用，我们用甘草苷处理了A549细胞。通过对差异表达基因进行KEGG和GO富集分析，我们进一步阐明了甘草苷抑制非小细胞肺癌的调控机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别