Ago2缺失恢复免疫治疗耐药肺癌对免疫检查点抑制剂敏感性的RNA-seq体内研究
该数据集来自 NCBI BioProject(编号 PRJNA1466226),主题为 Ago2 缺失恢复免疫治疗耐药肺癌对免疫检查点抑制剂的敏感性,采用 RNA-seq 体内实验
![PRJNA1466226: Ago2 loss restores sensitivity to immune checkpoint inhibitors in immunorefractory lung cancer [RNA-seq vivo]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/84751.jpg)
基本信息
资源简介
Ago2缺失恢复免疫治疗耐药肺癌对免疫检查点抑制剂敏感性的RNA-seq体内研究
该数据集收录于 NCBI BioProject,编号为 PRJNA1466226,英文标题为“Ago2 loss restores sensitivity to immune checkpoint inhibitors in immunorefractory lung cancer [RNA-seq vivo]”。从标题可以看出,该数据集围绕 Ago2 缺失与免疫检查点抑制剂敏感性恢复之间的关系展开,研究对象为免疫治疗耐药的肺癌,采用 RNA-seq 体内实验获取转录组数据。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,本站分类归入肿瘤 / 肺癌方向。该数据集为研究免疫治疗耐药机制、探索 Ago2 在免疫检查点抑制剂响应中的作用提供了转录层面的数据资源,适合从事肿瘤免疫、肺癌耐药机制以及基因表达调控研究的科研人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject,编号 PRJNA1466226。BioProject 是围绕某一项研究计划或倡议汇集生物数据的集合,通常由单一机构或联合体发起,旨在为用户提供一个统一入口,以便查找该项目所产生的多种类型数据。本项目的核心科学背景是免疫治疗耐药肺癌对免疫检查点抑制剂的敏感性恢复问题,研究聚焦于 Ago2 缺失这一条件,探索其与免疫检查点抑制剂敏感性之间的关联。本站将其归类为肿瘤 / 肺癌,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明该项目主要产生的是转录组或基因表达层面的数据。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。英文标题中标注了“[RNA-seq vivo]”,说明该数据集采用 RNA-seq 体内实验方式生成数据。数据集围绕“Ago2 loss restores sensitivity to immune checkpoint inhibitors in immunorefractory lung cancer”这一研究主题组织,涉及免疫治疗耐药肺癌在 Ago2 缺失条件下对免疫检查点抑制剂敏感性变化的相关转录组信息。除上述信息外,源站未提供更具体的数据内容细节,例如样本数量、测序平台、数据文件类型等。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Ago2 loss restores sensitivity to immune checkpoin... (ID 1466226) - BioProject - NCBI”。其采集与组织方式遵循 BioProject 的通用模式,即围绕单一研究计划汇集来自单一机构或联合体的生物数据,并为用户提供统一入口以查找该项目产生的多种数据类型。该数据集采用 RNA-seq 体内实验,属于转录组或基因表达主题。关于具体的采集时间、实验地点、样本来源机构等详细信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤免疫治疗耐药机制研究,尤其是肺癌对免疫检查点抑制剂耐药的相关探索。由于研究主题涉及 Ago2 缺失恢复免疫检查点抑制剂敏感性,该数据集可用于分析 Ago2 在免疫治疗响应中的潜在作用,也可用于转录组或基因表达层面的比较分析。其主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明,该数据适合基因表达差异分析、转录组水平的功能探索等场景。本站分类为肿瘤 / 肺癌,因此尤其适合肺癌相关的基础与转化研究使用。关于更具体的适用分析流程或推荐应用方向,源站未提供。
【使用方法】
该数据集来自 NCBI BioProject,用户可通过 BioProject 编号 PRJNA1466226 在 NCBI 站点查找并获取该项目所链接的多种数据类型。BioProject 记录的设计目的即为用户提供一个统一入口,以便发现和访问同一研究计划下生成的不同类型数据。因此,使用该数据集时,可先通过 BioProject 编号定位项目页面,再根据页面提供的链接获取相应的转录组或基因表达数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具或处理步骤,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公开的生物数据汇集记录。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,英文标题标注“[RNA-seq vivo]”,说明数据基于 RNA-seq 体内实验。关于数据质量指标、测序深度、重复次数、样本量、批次效应控制等具体质量信息,源站未提供。此外,该数据集仅围绕 Ago2 缺失与免疫检查点抑制剂敏感性恢复这一特定研究主题,使用时应结合具体研究问题进行判断。关于该数据集的局限性说明,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject,编号为 PRJNA1466226,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或授权信息,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1466226
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
晚期非小细胞肺癌(NSCLC)的一线治疗方法之一是免疫检查点抑制剂(ICI),其可激活抗肿瘤免疫反应。尽管取得了成功,但ICI对许多患者仍无效,这凸显了克服耐药策略的必要性。大多数研究致力于促进免疫细胞浸润难治性肿瘤,以提高ICI疗效。在这项工作中,我们通过聚焦于Argonaute 2(Ago2)——RNA干扰通路的关键成员——来推进这一方法。利用两种免疫难治性NSCLC小鼠模型,我们证明肿瘤Ago2抑制干扰素信号传导,导致免疫原性低下和ICI治疗失败。癌细胞中Ago2的基因缺失可恢复干扰素信号传导,并支持免疫细胞向肿瘤的浸润。因此,野生型肿瘤对ICI耐药,而缺乏Ago2的肿瘤则对治疗敏感。在接受ICI治疗的NSCLC患者中,肿瘤中高Ago2表达和低干扰素特征与生存期缩短相关。
因此,Ago2是NSCLC中观察到的免疫难治表型的驱动因素,当旨在使患者对ICI敏感时,它可能代表一个治疗靶点。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
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