PRJNA1465184:EGFR-TKI初治EGFR突变肺癌非炎症肿瘤微环境中抗PD-L1/VEGF免疫介导疗效有限
该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1465184),聚焦 EGFR-TKI 初治的 EGFR 突变肺癌,在非炎症肿瘤微环境中接受抗 PD-L1/VEGF 治疗的免疫介导疗效有限这一主题

基本信息
资源简介
PRJNA1465184:EGFR-TKI初治EGFR突变肺癌非炎症肿瘤微环境中抗PD-L1/VEGF免疫介导疗效有限
该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1465184,英文标题为“Limited Immune-Mediated Efficacy of Anti-PD-L1/VEGF in EGFR-TKI-Naïve Egfr-Mutant Lung Cancer with Non-Inflamed Tumor Microenvironment”。从标题与来源信息看,其主题聚焦于 EGFR-TKI 初治的 EGFR 突变肺癌,在非炎症肿瘤微环境中接受抗 PD-L1/VEGF 治疗时免疫介导疗效有限这一研究方向。数据集在来源站被归类于肿瘤/肺癌领域,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其涉及转录组或基因表达层面的数据。该记录来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 体系,属于围绕单一研究计划汇集多种生物数据的项目条目,便于用户集中定位该项目所产生的不同类型数据。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究背景围绕 EGFR 突变肺癌的治疗策略展开。具体而言,研究对象为 EGFR-TKI 初治的 EGFR 突变肺癌患者或相关模型,关注其在非炎症肿瘤微环境中接受抗 PD-L1/VEGF 治疗后的免疫介导疗效。标题中“Limited Immune-Mediated Efficacy”提示该研究探讨的是此类联合治疗在该特定人群与微环境条件下疗效受限的现象。BioProject 作为生物数据集合,通常来源于单一机构或联盟发起的单一研究计划,本数据集亦遵循这一组织方式,为相关数据提供统一入口。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明其数据内容涉及转录组或基因表达信息。源站描述指出,BioProject 记录为用户提供单一位置,以查找该项目所产生的多种数据类型。因此,该数据集可能包含与上述研究主题相关的基因表达或转录组数据,但具体的数据类型、样本数量、测序平台、分析流程等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录,编号为 1465184。源站描述说明,BioProject 是围绕单一研究计划收集生物数据的集合,这些数据来自单一组织或联盟。该记录提供链接以定位项目产生的多种数据类型。关于样本采集地点、时间、伦理审批信息、具体实验条件等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与 EGFR 突变肺癌、EGFR-TKI 初治状态、非炎症肿瘤微环境、抗 PD-L1/VEGF 治疗及免疫介导疗效相关的研究场景。由于主题标签为转录组或基因表达,其可能用于探索该治疗背景下基因表达层面的变化或机制。但具体适用分析类型、可支持的假设检验范围等,源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录(ID 1465184)访问该数据集,并利用 BioProject 提供的链接查找该项目产生的多种数据类型。关于数据下载方式、文件格式、分析工具、预处理步骤等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject,属于公共生物数据资源。其质量与限制的具体信息,如数据完整性、批次效应、样本量、测序深度、验证程度等,源站未提供。用户在使用时应参考源站记录及关联数据文件中的说明。
【引用与许可】
该数据集的引用方式与许可信息,源站未提供。用户应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关使用政策,并查阅源站记录以获取准确的引用要求与许可条款。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1465184
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EGFR突变肺癌患者对免疫检查点抑制剂的反应有限。在本研究中,我们发现抗PD-L1/VEGF联合治疗未能激活同基因Egfr突变肺癌小鼠模型中的肿瘤免疫。与紫杉醇(PTX)联合抗PD-L1不同,PTX联合抗VEGF增强了抗肿瘤效果并改变了肿瘤微环境(TME),显示出激活抗肿瘤免疫的潜力。为了研究这些机制,我们对单独或联合使用PTX和/或抗VEGF治疗的肿瘤进行了转录组分析。数据提示了一种潜在趋势,即PTX联合抗VEGF治疗可能与TME中自然杀伤(NK)细胞群体的适度增加相关。总体设计:从C57BL/6J小鼠皮下Egfr突变肺癌肿瘤中提取总RNA,这些肿瘤在治疗后第8天采集,治疗包括PBS(对照)、紫杉醇(PTX)、抗PD-L1和/或抗VEGF抗体。进行RNA-seq以评估治疗引起的基因表达谱和肿瘤免疫微环境变化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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