基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

A549肺癌细胞经铜(I)双膦配合物(Complex 1)处理的RNA测序

PRJNA1458791 是一个围绕 A549 肺癌细胞在铜(I)双膦配合物（Complex 1）处理条件下开展 RNA 测序的 BioProject 记录，归属于肿瘤 / 肺癌分类，来源为 NCBI。该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其核心数据类型是转录组或基因表达信息。整体而言，该数据可用于分析该配合物对肺癌细胞转录组的影响，研究差异表达基因及相关基因表达调控变化，为探索其抗肿瘤机制提供转录层面的数据支持。该记录为研究者提供了一个集中入口，用以发现和链接该项目所产生的多种数据类型。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一项单一研究计划而汇集的一组生物学数据，这些数据源自单一机构或某一联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，以便查找该项目所产生的不同类型数据之间的链接。本项目的英文名称为“PRJNA1458791: RNA sequencing of A549 lung cancer cells treated with a copper(I) bisphosphine complex (Complex 1)”，源站标题为“RNA sequencing of A549 lung cancer cells treated w... (ID 1458791) - BioProject - NCBI”。从名称可以看出，研究对象是 A549 肺癌细胞，处理条件为铜(I)双膦配合物（Complex 1），研究手段为 RNA 测序。本站将其归类于肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。

【数据内容】

该数据集的内容为 RNA 测序数据，针对经铜(I)双膦配合物（Complex 1）处理的 A549 肺癌细胞。其主题标签为 Transcriptome or Gene expression，说明数据涉及转录组或基因表达层面。根据侧写线索，该数据可用于分析该配合物对肺癌细胞转录组的影响，研究差异表达基因及相关基因表达调控变化，为探索其抗肿瘤机制提供转录层面的数据支持。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、重复数、具体差异基因列表等更细粒度的数据内容描述。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 记录，项目编号为 PRJNA1458791。BioProject 记录本身是围绕单一研究计划汇集的数据集合，来源于单一机构或联盟，并提供统一入口以链接该项目产生的多种数据类型。关于具体的样本采集地点、采集时间、实验操作流程、建库方法、测序仪器与试剂等信息，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与侧写线索，该数据集适用于转录组或基因表达相关分析，尤其是围绕 A549 肺癌细胞在铜(I)双膦配合物（Complex 1）处理下的基因表达变化研究。可用于分析该配合物对肺癌细胞转录组的影响，识别差异表达基因，研究相关基因表达调控变化，并为探索其抗肿瘤机制提供转录层面的数据支持。此外，作为 BioProject 记录，它也可作为入口，帮助用户发现和链接该项目所产生的其他数据类型。除上述场景外，源站未提供其他具体适用场景。

【使用方法】

该数据集为 NCBI BioProject 记录，用户可通过其项目编号 PRJNA1458791 在 NCBI 上定位该记录，并借助 BioProject 提供的统一入口查找该项目所产生的多种数据类型之间的链接。关于数据下载方式、文件格式、分析流程、软件参数等具体使用方法，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于围绕单一研究计划汇集的数据集合。关于数据质量指标、测序深度、覆盖度、重复性、批次效应、样本量、统计功效等具体质量信息，源站未提供。其主题标签为 Transcriptome or Gene expression，侧写线索指出该数据可用于分析该配合物对肺癌细胞转录组的影响，但相关结论仍需结合具体实验设计与分析加以判断。除上述内容外，源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 PRJNA1458791。关于引用方式、许可条款、使用限制等具体信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329396

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1458791

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

铜基配合物正逐渐成为有前景的抗癌药物，但其作用机制仍未完全阐明。在本研究中，我们评估了一系列新型双膦铜(I)硫代氨基甲酰胺配合物，并鉴定出配合物1——一种带有硫代氨基甲酰胺配体的双(三苯基膦)碘化铜(I)配合物——对肺癌细胞表现出选择性细胞毒性，而对正常成纤维细胞的毒性较低。为阐明其作用机制，我们在用配合物1处理A549细胞后进行了全转录组分析。细胞用5 µM配合物1或溶剂对照(DMSO)处理72小时后提取RNA。差异基因表达分析揭示了与p53信号通路、NF-κB信号通路及细胞周期调控相关通路的调节。这些发现得到了功能实验的支持，显示G2/M细胞周期阻滞，表明细胞周期进程的破坏是其主要作用方式，而细胞凋亡的贡献较小。

总体而言，本研究表明新型双膦铜(I)硫脲配合物能够发挥选择性抗癌活性，并为其对癌症相关信号网络的影响提供了机制见解，支持其作为治疗候选药物的进一步开发。总体设计：A549肺癌细胞用5 µM配合物1或溶剂对照(DMSO)处理72小时（每组n = 2个生物学重复）。提取总RNA并进行链特异性双端RNA测序（2 × 150 bp）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别