PRJNA1458136：EZH2 抑制重塑 3D 染色质结构诱导小细胞肺癌免疫原性表型 [RNA-Seq]
该数据集来自 NCBI BioProject（编号 1458136），主题为 EZH2 抑制重塑 3D 染色质结构以诱导小细胞肺癌免疫原性表型，数据基于 RNA-Seq，属于转录组或基因表达范畴
![PRJNA1458136: EZH2 inhibition reshapes 3D chromatin architecture to induce immunogenic phenotype in small cell lung cancer [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/84831.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA1458136：EZH2 抑制重塑 3D 染色质结构诱导小细胞肺癌免疫原性表型 [RNA-Seq]
PRJNA1458136 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物学研究项目，编号为 1458136，其英文名称为“EZH2 inhibition reshapes 3D chromatin architecture to induce immunogenic phenotype in small cell lung cancer [RNA-Seq]”。从名称可以看出，该项目围绕 EZH2 抑制与小细胞肺癌之间的关系展开，重点关注 EZH2 抑制如何重塑三维染色质结构，进而诱导小细胞肺癌产生免疫原性表型。项目所产生的数据基于 RNA-Seq 技术，属于转录组或基因表达范畴。在分类上，该数据集被归入肿瘤 / 肺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在为同一项研究计划所产生的多种数据类型提供统一的查找入口，便于研究者定位和获取相关数据。
【数据集背景】
该数据集对应的研究聚焦于小细胞肺癌这一肿瘤类型。小细胞肺癌是肺癌中具有高度侵袭性的亚型，其治疗与免疫应答机制是肿瘤研究关注的方向之一。项目标题明确指出研究涉及 EZH2 抑制、三维染色质结构重塑以及免疫原性表型诱导三个核心要素，表明该研究试图从表观遗传调控与染色质空间构象的角度，解释 EZH2 抑制如何影响小细胞肺癌的免疫相关表型。数据集所属的 BioProject 体系由 NCBI 维护，用于汇集来自单一机构或联合体的、与同一研究计划相关的生物学数据，使用户能够在一个记录中集中找到该项目产生的多种数据类型。该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据主体属于转录组或基因表达层面。
【数据内容】
依据项目名称中的“[RNA-Seq]”标识以及主题标签，该数据集的内容为 RNA-Seq 相关数据，属于转录组或基因表达范畴。RNA-Seq 通常用于检测样本中基因表达水平，因此该数据集可用于分析在 EZH2 抑制条件下小细胞肺癌细胞或相关样本的基因表达变化。项目标题同时提及三维染色质结构重塑与免疫原性表型，提示该 RNA-Seq 数据可能是研究这些生物学过程的组成部分之一。关于具体的样本数量、测序平台、读长、数据量、基因表达矩阵或差异表达结果等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，收录于 NCBI BioProject 数据库，项目编号为 1458136。BioProject 记录的作用是提供一个统一入口，使用户能够找到与同一研究计划相关的多种数据类型。该项目的英文名称中包含研究主题的完整描述，并标注了 RNA-Seq 这一数据生成方式。关于样本采集的具体地点、时间、机构、伦理审批信息以及实验操作流程等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是围绕小细胞肺癌、EZH2 抑制、三维染色质结构以及免疫原性表型等主题的分析。研究者可将其用于探索 EZH2 抑制后基因表达层面的变化，或作为研究染色质结构重塑与免疫表型之间关联的转录组证据来源。此外，由于该记录属于 BioProject 体系，也可作为查找同一研究计划下其他相关数据类型的入口。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问，项目编号为 1458136，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。使用者可依据项目编号在 BioProject 中检索该记录，并通过记录中的链接查找该项目产生的相关数据。关于数据下载的具体格式、分析流程、软件参数或预处理步骤等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开的生物学数据集合记录。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，数据基于 RNA-Seq。关于数据质量评估指标、测序深度、重复数、批次效应、数据完整性或潜在偏差等信息，源站未提供。使用者在使用时应结合项目标题所描述的研究范围理解数据的适用范围，并注意该记录本身为 BioProject 层面的集合描述，具体数据细节需参考源站进一步信息。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，收录于 NCBI BioProject，编号 1458136。关于该数据集的引用格式、许可条款或使用限制等，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1458136
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EZH2是Polycomb抑制复合物2（PRC2）的酶催化核心，在小细胞肺癌（SCLC）中过表达。既往研究表明，EZH2可强制介导免疫基因和DNA修复基因的表观遗传沉默，包括I类MHC分子（HLA-A/B/C）和SLFN11。为探究EZH1/2抑制如何重塑三维染色质景观及其与转录调控的关系，我们对经双重EZH1/2抑制剂valemetostat处理9天的神经内分泌SCLC细胞系（NCI-H146）进行了多组学分析。我们采用Micro-C测序进行高分辨率三维基因组图谱绘制，采用ATAC测序进行染色质可及性分析，并采用RNA测序进行全转录组分析。本数据集为RNA测序数据集。总体设计：细胞经双重EZH1/2抑制剂Valemetostat（2.5 µM）或DMSO溶剂对照处理9天，每3天更换含药培养基。所有测序实验均在处理后第9天采集的样本上进行，并设有生物学重复。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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