H23肺癌细胞暴露sotorasib后的miRNA表达谱

该数据集来自NCBI BioProject(ID 1454499),主题为H23肺癌细胞在暴露sotorasib后的miRNA表达谱分析,属于转录组或基因表达范畴

sra
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基因组回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA1454499: miRNA expression profiling in H23 lung cancer cells after sotorasib exposure

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

H23肺癌细胞暴露sotorasib后的miRNA表达谱

该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项转录组或基因表达研究,编号为 PRJNA1454499,英文名称为“miRNA expression profiling in H23 lung cancer cells after sotorasib exposure”。从名称可以看出,该研究聚焦于 H23 肺癌细胞在暴露于 sotorasib 之后的 miRNA 表达谱变化,属于肿瘤尤其是肺癌领域的分子表达研究。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明数据主要涉及转录组或基因表达层面的信息。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,本站将其归类为肿瘤 / 肺癌。整体而言,该数据集围绕特定肺癌细胞系在药物暴露条件下的 miRNA 表达特征展开,可为相关研究提供表达谱层面的数据线索。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号为 1454499。BioProject 是围绕某一项研究计划或倡议所生成的生物学数据的集合,这些数据可能来自单一机构,也可能来自联合体。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口,用于查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集的主题为 H23 肺癌细胞在暴露 sotorasib 后的 miRNA 表达谱分析,属于转录组或基因表达范畴。本站将其归入肿瘤 / 肺癌分类,说明其研究对象与肺癌相关。源站标题显示为“miRNA expression profiling in H23 lung cancer cell... (ID 1454499) - BioProject - NCBI”,进一步表明该记录是 NCBI BioProject 中关于 H23 肺癌细胞 miRNA 表达谱的项目条目。

【数据内容】

该数据集的核心内容为 miRNA 表达谱分析,研究对象是 H23 肺癌细胞,处理条件为暴露于 sotorasib。主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明数据属于转录组或基因表达类型。数据集英文名称明确指向“miRNA expression profiling”,即 miRNA 表达谱检测。关于具体的样本数量、测序平台、表达矩阵、差异表达结果、统计学指标等细节,源站未提供。该数据集可能包含与 miRNA 表达相关的原始数据或加工数据,但具体的数据文件类型、数据量、格式等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的记录,项目 ID 为 1454499。源站描述指出,BioProject 是围绕单一研究计划或倡议所收集的生物学数据集合,可能来自单一组织或联合体,并提供链接以查找该项目产生的多种数据类型。该数据集的具体采集方法、实验设计、细胞培养条件、sotorasib 暴露剂量与时间、miRNA 提取与检测手段、测序或芯片平台等信息,源站未提供。数据提交机构、项目负责人、资助来源等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与肺癌分子机制、miRNA 表达调控、药物暴露后转录组变化等相关的研究场景。由于主题涉及 H23 肺癌细胞在 sotorasib 暴露后的 miRNA 表达谱,可能可用于探索 sotorasib 对肺癌细胞 miRNA 表达的影响,或用于比较不同条件下的 miRNA 表达差异。其主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明其可服务于基因表达分析、转录组研究等方向。本站分类为肿瘤 / 肺癌,提示其可应用于肿瘤学尤其是肺癌相关研究。具体适用的分析类型、可支持的假设检验、是否可用于临床转化研究等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录进行访问,项目 ID 为 1454499,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。用户可通过 BioProject 记录查找该项目所链接的多种数据类型。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具、参数设置等,源站未提供。是否提供原始测序数据、表达矩阵或差异表达列表,源站未提供。使用时应参考 NCBI BioProject 页面所提供的链接与说明,但具体操作细节需以源站实际内容为准。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,属于公共数据库记录。源站描述仅说明 BioProject 是生物学数据的集合,并提供查找多种数据类型的入口,未提供该数据集的具体质量控制指标、数据完整性、样本量、重复数、测序深度、覆盖度、批次效应等信息。该数据集仅涉及 H23 肺癌细胞在 sotorasib 暴露后的 miRNA 表达谱,研究结论是否可推广至其他细胞系、其他药物或其他疾病模型,源站未提供。数据的使用应结合源站记录中的具体信息进行判断,避免过度推断。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用限制、是否允许商业使用、是否需要署名等信息,源站未提供。用户在使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 记录中可能提供的引用指南与相关条款。由于源站未提供具体的引用格式与许可声明,建议直接访问 NCBI BioProject 页面获取最新信息。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1454499

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Sotorasib是KRAS G12C的选择性抑制剂。本研究通过测序分析了携带KRAS G12C突变的H23肺癌细胞在暴露于sotorasib后miRNA表达的变化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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