基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

DYRK1B 过表达促进 A549 肺癌细胞衰老样转录与分泌程序

该数据集为 NCBI BioProject 数据库中的一项记录，编号 1446780，英文名称为“PRJNA1446780: DYRK1B Overexpression Promotes Senescence-Like Transcriptional and Secretory Programs in A549 Lung Cancer Cells”。从名称可以看出，该研究聚焦于 DYRK1B 基因过表达在 A549 肺癌细胞中所诱导的衰老样转录与分泌程序。数据集主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达，属于肿瘤/肺癌研究领域。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示为“DYRK1B Overexpression Promotes Senescence-Like Tr... (ID 1446780) - BioProject - NCBI”。整体而言，该数据集围绕肺癌细胞中 DYRK1B 过表达后的基因表达变化展开，可用于探索该基因在肿瘤细胞衰老样表型及分泌功能中的潜在作用。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject，编号 1446780。BioProject 是 NCBI 提供的一种资源组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物数据。根据源站描述，一个 BioProject 记录通常源自单一组织或联盟，并为用户提供统一入口，以查找该项目所产生的不同类型数据。本数据集所对应的研究计划，其核心科学问题围绕 DYRK1B 过表达在 A549 肺癌细胞中引发的衰老样转录与分泌程序。A549 是肺癌研究中常用的细胞系，而 DYRK1B 是一种激酶，其过表达可能影响细胞周期、衰老及分泌表型。该数据集被归类于肿瘤/肺癌方向，主题标签为转录组或基因表达，说明其数据主体与基因表达谱相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其内容涉及转录组或基因表达层面的数据。数据集英文名称明确指出研究对象为 A549 肺癌细胞，实验条件为 DYRK1B 过表达，观察的表型为衰老样转录与分泌程序。因此，数据内容可能包括在 DYRK1B 过表达条件下获得的基因表达信息，用于分析转录水平的变化以及可能与分泌程序相关的基因表达特征。不过，关于具体样本数量、测序平台、数据文件类型、表达矩阵或差异表达基因列表等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一项记录，编号 1446780。源站标题为“DYRK1B Overexpression Promotes Senescence-Like Tr... (ID 1446780) - BioProject - NCBI”。BioProject 作为数据汇集入口，通常链接到该项目产生的多种数据类型。该数据集被本站分类为肿瘤/肺癌，主题标签为转录组或基因表达。关于样本采集的具体方法、细胞培养条件、过表达构建方式、测序或检测平台、实验重复次数等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与肺癌细胞生物学、基因表达调控及细胞衰老相关的研究场景。具体而言，可用于分析 DYRK1B 过表达对 A549 肺癌细胞转录组的影响，探索衰老样转录程序的特征，以及研究可能与分泌表型相关的基因表达变化。由于主题标签为转录组或基因表达，该数据集也可用于比较不同条件下的表达谱，或作为肺癌相关基因表达研究的参考数据。此外，对于关注 DYRK1B 功能、A549 细胞模型以及肿瘤细胞衰老机制的研究者，该数据集可能具有参考价值。但关于其具体适用分析类型、是否包含原始测序数据或处理后数据等，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问，记录编号为 1446780。用户可在 NCBI 网站中检索该 BioProject ID，以获取该项目所链接的数据类型和相关信息。由于 BioProject 记录提供统一入口，用户可能通过该页面进一步跳转至相关的转录组或基因表达数据。关于数据下载方式、文件格式、分析工具、预处理步骤或代码等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共数据库记录。其主题标签为转录组或基因表达，研究内容聚焦于 DYRK1B 过表达在 A549 肺癌细胞中的效应。然而，关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、重复性、验证实验、统计分析方法及潜在偏差等信息，源站未提供。此外，该数据集仅涉及 A549 细胞系，其结论能否推广至其他肺癌模型或临床样本，源站未提供。用户在使用时应结合原始项目中的具体实验设计和数据质量报告进行判断。

【引用与许可】

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1446780

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1446780

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们研究了A549肺癌细胞中的转录变化，以表征DYRK1B激酶过表达对人A549肺癌细胞表型的影响。总体设计：对具有四环素诱导表达野生型或突变型（Y273F）DYRK1B的A549细胞的RNA-seq数据进行基因表达谱比较分析。每种细胞类型（WT和Y273F）分别接受多西环素处理或未处理7天。数据来自三个独立细胞群体，这些群体平行培养并裂解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别