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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1441527：9α,11α-二羟基-贝壳杉烯酸（AL-X）处理人NSCLC细胞系的RNA-seq分析

PRJNA1441527 是一个聚焦肿瘤学与肺癌方向的转录组数据集，其完整英文名称为“RNA-seq analysis of human NSCLC cell lines treated with 9α,11α-dihydroxy-kaurenoic acid (AL-X)”。该数据集收录于 NCBI BioProject 数据库，项目编号为 1441527，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达。整体来看，该数据集围绕人非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系展开，研究其在 9α,11α-二羟基-贝壳杉烯酸（AL-X）处理后的 RNA-seq 分析结果，旨在通过高通量测序手段获取处理前后细胞转录组层面的基因表达信息。本站将其归类为肿瘤 / 肺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，适合关注肺癌转录组、药物处理响应以及基因表达调控的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject，BioProject 是围绕某一项单一研究计划而汇集起来的生物数据集合，这些数据通常来自单一机构或某个联合体。BioProject 记录为用户提供了一个统一的入口，便于查找该项目所产生的多种类型数据。本项目编号为 1441527，其研究主题聚焦于人非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系在接受 9α,11α-二羟基-贝壳杉烯酸（AL-X）处理后的转录组变化。非小细胞肺癌是肺癌中的主要类型之一，围绕其细胞系开展 RNA-seq 分析，有助于在转录水平上观察药物处理所引起的基因表达改变。该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其核心数据属于转录组或基因表达范畴。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 RNA-seq 分析，研究对象为人 NSCLC 细胞系，处理条件为 9α,11α-二羟基-贝壳杉烯酸（AL-X）。从标题与主题标签可以确认，数据所对应的是转录组或基因表达层面的信息。关于具体的样本数量、测序平台、读长、重复次数、表达矩阵或差异表达基因列表等细节，源站未提供。本站分类将其归入肿瘤 / 肺癌，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，这些信息可用于判断数据所属的组学类型与疾病领域。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，收录于 NCBI BioProject，项目 ID 为 1441527。源站标题为“RNA-seq analysis of human NSCLC cell lines treated... (ID 1441527) - BioProject - NCBI”。BioProject 作为生物数据的汇集记录，提供指向该项目所生成多种数据类型的链接入口。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、细胞系来源机构以及建库测序的具体流程，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于转录组与基因表达相关的研究场景，尤其是围绕人非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系在 9α,11α-二羟基-贝壳杉烯酸（AL-X）处理后的表达变化分析。潜在用途包括：在转录水平上考察药物处理对肺癌细胞基因表达的影响、作为肺癌转录组研究的参考数据、以及与其他 NSCLC 转录组数据集进行比较分析等。由于本站分类为肿瘤 / 肺癌，该数据也可服务于肺癌相关的基础研究。关于该数据集是否适用于临床转化、药物靶点验证或生物标志物发现等具体方向，源站未提供明确说明。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 获取，项目 ID 为 1441527，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。用户可借助 BioProject 记录查找该项目所链接的多种数据类型。关于数据的具体下载方式、文件格式、分析流程、参考基因组版本以及推荐的分析工具，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，聚焦人 NSCLC 细胞系在 AL-X 处理后的 RNA-seq 分析。关于数据质量指标、测序深度、重复性、批次效应、样本量大小以及是否存在技术偏差等信息，源站未提供。使用者在缺乏这些细节的情况下，应谨慎评估数据是否满足其研究需求。此外，该数据集基于细胞系模型，关于其与临床样本或体内模型之间的可比性，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目 ID 为 1441527，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否存在使用限制，源站未提供。使用者应自行查阅 NCBI BioProject 页面以获取相关的引用与许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE325732

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1441527

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

非小细胞肺癌（NSCLC）仍然是全球癌症相关死亡的主要原因。在本研究中，我们进行了bulk RNA测序，以探究9α,11α-二羟基-贝壳杉烯酸（9α,11αOH-KA，也称为AL-X）对人NSCLC细胞的转录组学效应。A549、HCC827和H1975细胞系分别用10 μg/mL 9α,11αOH-KA或溶剂对照（DMSO）处理48小时。提取总RNA，并使用Illumina平台进行双端测序。该数据集为理解9α,11αOH-KA在NSCLC中诱导线粒体功能障碍和抗癌效应的分子机制提供了全面的资源。总体设计：三种人NSCLC细胞系（A549、HCC827和H1975）分别用DMSO（对照）或10 μg/mL 9α,11αOH-KA处理48小时。提取总RNA，用于文库构建和双端RNA测序（Illumina平台）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别