PRJNA1435450:AURKA与WEE1联合抑制在EGFR或pan-ERBB抑制剂耐药头颈部鳞状细胞癌中显示疗效

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1435450),主题为转录组或基因表达,聚焦于头颈部鳞状细胞癌在 EGFR 或 pan-ERBB 抑制剂耐药背景下,AURKA 与 WEE1 联合抑制所表现出的疗效

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时间序列预测Transcriptome or Gene expression
PRJNA1435450: Combination AURKA and WEE1 inhibition exhibits efficacy in EGFR or pan-ERBB inhibitor resistant head and neck squamous cell carcinoma

基本信息

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任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1435450:AURKA与WEE1联合抑制在EGFR或pan-ERBB抑制剂耐药头颈部鳞状细胞癌中显示疗效

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1435450),英文名称为“PRJNA1435450: Combination AURKA and WEE1 inhibition exhibits efficacy in EGFR or pan-ERBB inhibitor resistant head and neck squamous cell carcinoma”。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,即转录组或基因表达。数据集聚焦于头颈部鳞状细胞癌在 EGFR 或 pan-ERBB 抑制剂耐药背景下,AURKA 与 WEE1 联合抑制所表现出的疗效。本站将其归类于肿瘤 / 肺癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体来看,该数据集围绕特定肿瘤耐药模型中的联合用药效应,提供与基因表达相关的生物学数据入口,适合关注头颈部鳞状细胞癌耐药机制与联合靶向治疗的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集对应的源站标题为“Combination AURKA and WEE1 inhibition exhibits eff... (ID 1435450) - BioProject - NCBI”。从标题可知,其研究背景是头颈部鳞状细胞癌对 EGFR 或 pan-ERBB 抑制剂产生耐药,而 AURKA 与 WEE1 的联合抑制在该耐药背景下表现出疗效。BioProject 作为 NCBI 的资源类型,用于汇集与某一项单一研究计划相关的生物学数据,这些数据来自单一机构或联合体。该记录为用户提供一个统一入口,以便找到该项目所产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明其数据内容与转录组或基因表达相关。本站分类将其归入肿瘤 / 肺癌方向,但源站标题与描述明确指向头颈部鳞状细胞癌,因此其核心研究语境应以上述标题所述肿瘤类型和耐药背景为准。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其涉及转录组或基因表达层面的数据。源站描述指出,BioProject 记录提供用户一个单一位置,用于查找为该项目生成的多种数据类型。因此,该数据集可能包含与项目相关的多种数据链接,而不仅限于单一类型的数据。不过,关于具体样本数量、测序平台、基因列表、表达矩阵、差异表达结果、统计指标或验证实验等细节,源站未提供。该数据集的核心内容围绕 AURKA 与 WEE1 联合抑制在 EGFR 或 pan-ERBB 抑制剂耐药的头颈部鳞状细胞癌中的疗效这一研究主题展开,但具体数据文件、数据格式与数据规模等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,具体记录为 NCBI BioProject(ID 1435450)。源站描述说明,BioProject 是汇集与单一研究计划相关的生物学数据的资源,该计划来自单一机构或联合体。该记录为用户提供统一入口,以查找该项目产生的多种数据类型。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者或模型来源、实验设计细节、测序或检测方法等,源站未提供。该数据集在 NCBI BioProject 中的标题为“Combination AURKA and WEE1 inhibition exhibits eff... (ID 1435450) - BioProject - NCBI”,其英文全称为“PRJNA1435450: Combination AURKA and WEE1 inhibition exhibits efficacy in EGFR or pan-ERBB inhibitor resistant head and neck squamous cell carcinoma”。除上述来源与标题信息外,更详细的采集与来源信息源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于关注头颈部鳞状细胞癌在 EGFR 或 pan-ERBB 抑制剂耐药背景下,AURKA 与 WEE1 联合抑制疗效的研究场景。由于其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,可适用于转录组或基因表达相关的分析需求,例如探索耐药机制、联合用药后的表达变化或相关信号通路研究。本站分类为肿瘤 / 肺癌,因此也可能被用于肿瘤学领域中与靶向治疗耐药相关的数据检索与整合。该数据集作为 NCBI BioProject 记录,适合需要从一个统一入口获取该项目多种数据类型的用户。关于具体适用分析类型、疾病模型、临床转化场景或药物开发阶段等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录(ID 1435450)进行访问,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。用户可借助该 BioProject 记录查找为该项目生成的多种数据类型。由于源站描述指出 BioProject 提供用户一个单一位置来发现相关数据类型的链接,因此使用方法应以该记录为入口,进一步跳转至项目所关联的具体数据资源。关于数据下载方式、文件格式、分析工具、代码、流程参数或访问权限等,源站未提供。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,用户可据此判断其数据方向,但具体使用步骤与操作指南源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,属于公共数据库记录。源站描述仅说明 BioProject 是相关生物学数据的集合,并提供统一查找入口,未提供关于数据质量、完整性、准确性、批次效应、样本量、重复数或验证程度的具体信息。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,但具体数据质量指标源站未提供。本站分类为肿瘤 / 肺癌,而源站标题明确指向头颈部鳞状细胞癌,两者在肿瘤类型上存在差异,使用时需注意以源站标题所述研究背景为准。关于数据限制、使用约束、技术偏差或解释边界等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 NCBI BioProject(ID 1435450),英文名称为“PRJNA1435450: Combination AURKA and WEE1 inhibition exhibits efficacy in EGFR or pan-ERBB inhibitor resistant head and neck squamous cell carcinoma”。关于引用方式、许可协议、使用条款、版权声明或数据共享政策等,源站未提供。用户在使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 记录及其关联资源所附带的引用与许可要求,但具体内容源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1435450

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

全球每年诊断出超过60万例头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)。许多HNSCC过表达ERBB家族成员EGFR,EGFR抑制剂(EGFRis)和泛ERBB抑制剂(ERBBis)在局部晚期、转移性或复发性HNSCC的治疗中具有临床活性。然而,对这些抑制剂的耐药性通常会出现,且往往与上皮-间质转化(EMT)相关。Aurora激酶A(AURKA)是一种有丝分裂调节因子,在肿瘤中具有扩展的信号传导功能,据报道可逆转EGFR突变型肺癌中的EGFR耐药性。为确定克服HNSCC耐药性的策略,我们开发了HNSCC细胞模型,包括未经治疗的亲本细胞,或筛选出对EGFRi厄洛替尼或ERBBi阿法替尼耐药的细胞。耐药HNSCC模型通常经历了部分EMT,与临床耐药性一致,并伴有AURKA伴侣蛋白NEDD9的上调。在短期生长实验中,AURKA抑制剂VIC-1911与厄洛替尼或阿法替尼在亲本模型中的协同作用在耐药模型中有所降低。

在较长期的克隆形成实验和体内实验中,对EGFRi/ERBBi耐药筛选出的细胞对VIC-1911表现出更高的敏感性,导致协同作用降低。基于AURKA依赖性增加,我们比较了VIC-1911与adavosertib(一种细胞周期检查点调节因子WEE1的抑制剂)联合使用在亲本与耐药模型中的效果。这些结果显示,在体外和体内均具有联合效应,且在ERBBi耐药异种移植瘤中得以保留,提示联合使用AURKA和WEE1抑制剂在ERBB抑制剂耐药的HNSCC患者中具有潜在价值。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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