STMN2/β-alanine 调控小细胞肺癌神经侵袭的代谢重编程 [近端与远端 RNA-seq]
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1430247），主题为 STMN2/β-alanine 调控小细胞肺癌神经侵袭的代谢重编程，包含近端与远端 RNA-seq 数据
![PRJNA1430247: Regulation of neuronal invasion of small cell lung cancer by STMN2/β-alanine-controlled metabolic reprogramming [Proximal_and_Distal-RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/105873.jpg)
基本信息
资源简介
STMN2/β-alanine 调控小细胞肺癌神经侵袭的代谢重编程 [近端与远端 RNA-seq]
该数据集为 NCBI BioProject 收录项目（ID 1430247），英文名称为 PRJNA1430247: Regulation of neuronal invasion of small cell lung cancer by STMN2/β-alanine-controlled metabolic reprogramming [Proximal_and_Distal-RNA-seq]。其研究主题聚焦于 STMN2/β-alanine 所调控的代谢重编程如何影响小细胞肺癌的神经侵袭过程，数据内容为近端与远端 RNA-seq 数据。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，该数据集围绕小细胞肺癌神经侵袭这一特定生物学问题，提供了转录组或基因表达层面的数据资源，可供相关研究者在肺癌代谢与神经相互作用方向上进行检索与使用。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1430247），其研究主题为 STMN2/β-alanine 调控小细胞肺癌神经侵袭的代谢重编程。小细胞肺癌是肺癌中具有高度侵袭性的类型，神经侵袭是其重要病理特征之一，而代谢重编程在肿瘤进展中的作用受到广泛关注。该 BioProject 将上述研究方向作为单一研究计划进行数据组织。根据源站描述，BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合，该计划可来自单一机构或联合体；BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集在分类上属于肿瘤 / 肺癌，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其数据性质与转录组或基因表达相关。
【数据内容】
该数据集包含近端与远端 RNA-seq 数据，对应英文名称中标注的 Proximal_and_Distal-RNA-seq。其研究主题涉及 STMN2/β-alanine 调控小细胞肺癌神经侵袭的代谢重编程。数据在主题上归属于 Transcriptome or Gene expression，即转录组或基因表达范畴。除上述信息外，关于样本数量、测序平台、读长、数据量、具体基因列表或差异表达结果等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Regulation of neuronal invasion of small cell lung... (ID 1430247) - BioProject - NCBI”。其 BioProject 编号为 1430247。根据源站描述，BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的生物数据，并提供统一入口以链接该项目产生的多种数据类型。关于具体的采集地点、采集时间、样本处理流程、测序机构或伦理审批信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与小细胞肺癌神经侵袭、STMN2/β-alanine 相关代谢重编程以及近端与远端转录组比较相关的研究场景。其主题标签为 Transcriptome or Gene expression，因此可用于基因表达层面的检索、整合分析或作为相关研究的参考数据资源。该数据集归属于肿瘤 / 肺癌分类，适合肺癌分子机制研究方向的使用者关注。关于具体的分析应用、疾病模型或临床转化场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 记录（ID 1430247）进行访问，用户可借助 BioProject 提供的统一入口查找该项目所链接的多种数据类型。根据源站描述，BioProject 记录的作用在于集中呈现与单一研究计划相关的数据链接。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 收录项目，编号为 1430247，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。关于数据质量评估指标、覆盖度、重复数、批次效应、技术偏差或验证实验结果等，源站未提供。使用者应注意，该数据集的具体质量信息需以源站记录及其链接的数据资源为准。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Regulation of neuronal invasion of small cell lung... (ID 1430247) - BioProject - NCBI”。关于具体的引用格式、作者列表、发表文献、数据许可条款或使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1430247
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
小细胞肺癌（SCLC）是一种高度侵袭性的神经内分泌恶性肿瘤，以快速进展和预后不良为特征。神经周围侵犯（PNI）现象在SCLC中普遍存在，是一项关键的临床病理特征；然而，其机制及其对疾病进展和患者生存的影响仍不清楚。在本研究中，我们基于手术队列证据，将PNI确立为SCLC的独立不良预后因素。我们进一步证明，神经微环境上调SCLC细胞中STMN2——一种神经元特异性微管去稳定蛋白。在机制上，STMN2以浓度依赖性方式激活β-丙氨酸代谢通路，导致细胞内β-丙氨酸水平升高，从而增强肿瘤细胞迁移和侵袭。体内实验证实，敲低STMN2可显著抑制SCLC中的神经侵犯，而外源性β-丙氨酸补充可逆转这一效应。总之，这些发现揭示了SCLC中的神经-STMN2-β-丙氨酸-侵袭轴。
本研究不仅为神经侵袭提供了新的机制见解，还突出了一个有前景的治疗靶点，以对抗PNI，强调了其重要的转化相关性。总体设计：使用DMS114细胞的坐骨神经侵袭模型中，来自近端和远端侵袭区域的肿瘤接受了下一代测序，随后进行了差异基因表达分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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