PRJNA1425783：FOXM1在肺癌中普遍存在且可通过T细胞受体工程靶向
数据围绕肺癌中 FOXM1 的表达与 T 细胞受体工程靶向研究展开，可用于转录组与基因表达分析、肺癌相关靶点探索及免疫治疗策略研究
基本信息
资源简介
PRJNA1425783：FOXM1在肺癌中普遍存在且可通过T细胞受体工程靶向
PRJNA1425783 是一个围绕肺癌中 FOXM1 表达特征及 T 细胞受体工程靶向策略展开的生物学研究项目数据集，英文全称为“FOXM1 is prevalent in lung cancer and targetable via T cell receptor engineering”。该数据集归属于肿瘤 / 肺癌分类，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其核心数据与转录组或基因表达分析相关。整体来看，该数据集可用于探索 FOXM1 在肺癌中的表达情况，以及通过 T 细胞受体工程实现靶向干预的研究方向，适合关注肺癌分子机制、基因表达谱分析以及免疫治疗策略的研究人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，项目编号为 1425783。BioProject 是围绕某一特定研究计划或倡议所组织的生物学数据集合，通常由单一机构或联盟发起，旨在为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种类型数据。该项目的标题明确指出其研究焦点为 FOXM1 在肺癌中的普遍存在及其通过 T 细胞受体工程进行靶向的可行性。这一背景说明该数据集并非单纯的基因表达测量，而是与肺癌靶点发现和免疫治疗策略开发密切相关的综合性研究资源。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容主要涉及转录组或基因表达层面的信息。结合项目标题与侧写线索，数据围绕肺癌中 FOXM1 的表达与 T 细胞受体工程靶向研究展开。因此，数据内容可能包括与 FOXM1 表达相关的转录组数据，以及用于支持 T 细胞受体工程靶向研究的基因表达信息。这些数据可用于分析 FOXM1 在肺癌中的表达模式，并为进一步探索其作为免疫治疗靶点的潜力提供基础。关于具体样本数量、测序平台、数据文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 数据库。BioProject 记录本身并不直接包含所有原始数据，而是提供指向该项目所生成的各种数据类型链接的集中入口。该项目由单一组织或联盟发起，具体发起机构名称、采集地点、采集时间、样本来源及伦理审批信息等，源站未提供。用户可通过 NCBI BioProject 页面访问该项目，并进一步跳转至相关的数据存储或分析资源。
【适用场景】
该数据集适用于多种研究场景。首先，可用于转录组与基因表达分析，特别是针对肺癌中 FOXM1 表达特征的研究。其次，可用于肺癌相关靶点的探索，帮助识别 FOXM1 作为潜在治疗靶点的价值。第三，可用于免疫治疗策略研究，尤其是围绕 T 细胞受体工程靶向 FOXM1 的可行性评估。此外，该数据集还可为肺癌分子机制研究、生物标志物发现以及个性化免疫治疗方案的开发提供数据支持。对于从事肿瘤免疫学、肺癌转录组学以及基因工程 T 细胞研究的科研人员，该数据集具有参考价值。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库检索项目编号 PRJNA1425783 或相关标题来访问该数据集。BioProject 记录提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接，用户可根据需要下载或浏览相关数据。具体的数据下载方式、文件格式、分析工具及处理流程等，源站未提供。建议用户结合 NCBI 提供的其他资源，如 Sequence Read Archive（SRA）或 Gene Expression Omnibus（GEO），以获取更完整的原始数据与分析结果。使用时应遵循 NCBI 的数据使用政策及相关许可要求。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共数据库中的项目记录，其数据质量依赖于原始研究的设计与执行。由于 BioProject 记录本身是数据链接的集合，而非直接的数据存储库，用户在使用时需注意不同数据类型的可用性和完整性。关于该数据集的具体质量评估指标、数据验证方法、样本量大小、测序深度及潜在偏差等信息，源站未提供。此外，该数据集仅围绕 FOXM1 在肺癌中的表达与 T 细胞受体工程靶向研究，其适用范围可能受限于特定研究背景，不宜直接外推至其他癌症类型或治疗策略。
【引用与许可】
使用该数据集时，应引用对应的 BioProject 记录，项目编号为 PRJNA1425783，标题为“FOXM1 is prevalent in lung cancer and targetable via T cell receptor engineering”。关于具体的引用格式、许可协议、数据使用限制及版权信息，源站未提供。用户应参考 NCBI 官方网站上的通用引用指南与数据使用政策，并尊重原始研究者的知识产权。在发表研究成果时，建议同时引用原始研究论文（如有）及 BioProject 记录，以确保数据来源的准确标注。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1425783
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们鉴定出源自FOXM1的表位，这些表位在HLA-A02:01、HLA-A24:02和HLA-A*23:01上具有免疫原性，经过内源性加工和呈递，并能引发T细胞活化和细胞毒性T细胞反应。在生成TCR-T细胞后，分别通过肽剂量反应和X扫描确认了其敏感性和特异性。最重要的是，过继转移TCR工程化T细胞导致肿瘤生长显著减少，并在NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJ（NSG）荷瘤小鼠模型中显著延长了生存期。我们的研究证实了FOXM1的免疫原性以及利用TCR工程化靶向该抗原的可行性。总体设计：使用scRNAseq分析扩增的、反应性抗原特异性T细胞，以识别和合成CDR3 α/β序列组装。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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