PRJNA1424976：CD47 促进 MAPK 与上皮间质转化分子程序驱动非小细胞肺癌促转移表型
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1424976），主题为转录组或基因表达，聚焦 CD47 通过 MAPK 与上皮间质转化分子程序驱动非小细胞肺癌促转移表型的研究
基本信息
资源简介
PRJNA1424976：CD47 促进 MAPK 与上皮间质转化分子程序驱动非小细胞肺癌促转移表型
该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1424976，英文标题为“CD47 promotes MAPK and epithelial-to-mesenchymal transition molecular programs to drive pro-metastatic phenotypes in non-small cell lung cancer”。从标题可以看出，该研究围绕非小细胞肺癌展开，关注 CD47 在 MAPK 信号通路与上皮间质转化（EMT）分子程序中的作用，以及这些分子程序如何驱动促转移表型。数据集在分类上归属于肿瘤／肺癌方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其核心数据类型与转录组或基因表达相关。整体而言，这是一个依托 NCBI BioProject 平台发布的、聚焦非小细胞肺癌中 CD47 相关分子机制研究的生物学项目记录，可供检索和关联该项目下产生的多种数据类型。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号为 1424976。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目记录形式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物学数据。按照 NCBI 的说明，一个 BioProject 通常源自单一机构或联合体，并为用户提供一个统一入口，以便找到该项目所产生的多种数据类型。该项目的标题明确指向非小细胞肺癌研究，核心科学问题是 CD47 如何促进 MAPK 与上皮间质转化分子程序，进而驱动促转移表型。因此，该数据集在背景上属于肿瘤生物学、肺癌分子机制与基因表达研究交叉的范畴。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容与转录组或基因表达相关。项目标题涉及 CD47、MAPK、上皮间质转化以及非小细胞肺癌的促转移表型，说明这些表达数据可能用于研究上述分子程序在肺癌中的变化。除主题标签和标题所反映的内容外，源站未提供更具体的数据类型、样本数量、测序平台或分析结果等信息。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录形式为 BioProject，编号 1424976。根据源站描述，BioProject 记录本身是围绕单一研究计划组织起来的生物数据集合，可链接到该项目产生的多种数据类型。该数据集所属分类为肿瘤／肺癌，主题标签为转录组或基因表达。关于具体样本采集方式、实验设计、组织来源或测序方法，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与非小细胞肺癌分子机制相关的研究场景，尤其是关注 CD47、MAPK 信号通路、上皮间质转化以及肿瘤转移表型的转录组或基因表达分析。研究人员可将其作为检索入口，查找该项目关联的基因表达数据，用于探索上述分子程序在非小细胞肺癌中的表达特征。也可用于肿瘤生物学中基因表达数据的整合分析或方法学参考。具体适用场景需结合源站提供的实际数据内容判断，源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
该数据集以 NCBI BioProject 记录的形式提供，用户可通过编号 1424976 在 NCBI 站点检索并访问该项目。BioProject 记录的作用是汇集与单一研究计划相关的多种数据类型，因此使用者可通过该记录查找项目关联的数据链接。关于数据下载、格式、分析流程或软件工具，源站未提供具体说明。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共数据库中的项目记录。其质量与限制取决于项目本身提交的数据及 NCBI 的收录标准。当前可确认的信息包括项目编号、标题、分类、来源站、主题标签以及 BioProject 的通用描述。关于样本质量、数据完整性、测序深度、重复性、统计方法或验证实验等信息，源站未提供。因此，在使用该数据集时，应结合源站记录中实际关联的数据进行判断，不宜仅凭项目标题推断具体结论。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject，编号 1424976，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。使用者应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关政策，并参考源站记录中可能提供的引用信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1424976
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
CD47最为人所知的是其在肿瘤免疫逃逸中的作用；然而，多种细胞模型的研究表明，它还具有细胞自主的、促进肿瘤的功能，这些功能具有细胞类型和情境特异性。鉴于CD47的预后和治疗意义，以及在非小细胞肺癌（NSCLC）中对其超越免疫逃逸作用的认识有限，我们旨在明确NSCLC中由内在CD47信号驱动的细胞和分子过程。对CD47野生型和敲除NSCLC细胞的转录组分析显示，其调控的基因富集于MAPK信号传导和上皮-间质转化（EMT）特征。在大型NSCLC细胞系和肿瘤组织队列中，CD47与MAPK/EMT表达特征之间也存在显著的正相关。功能研究表明，CD47并不像在其他癌症类型中那样调控NSCLC细胞的增殖。相反，CD47通过ERK和EMT轴调控细胞黏附和迁移，验证了我们的转录组学发现。
此外，CD47功能缺失显著削弱了NSCLC细胞在体内的转移能力，证明了肺癌细胞中细胞内在CD47信号传导的生理相关性。我们的数据揭示了CD47通过ERK传递信号以促进NSCLC中EMT表达程序及促转移表型的新作用。尽管需要更多机制性研究来进一步阐明CD47-ERK-EMT信号通路，但我们的发现强化了CD47的治疗潜力，为进一步研究开发CD47阻断作为NSCLC多模式治疗提供了依据。总体设计：对体外收集的克隆野生型和CRISPR介导的CD47敲除Lewis肺癌细胞(LLC)进行RNA-seq分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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