LncRNA NAS1 缺失驱动非小细胞肺癌顺铂耐药

数据围绕非小细胞肺癌中 NAS1 缺失与顺铂耐药关系展开,可用于研究 lncRNA 在肺癌化疗耐药中的表达变化及相关转录组分析(来源 NCBI)

sra
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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1420689: LncRNA NAS1 deficiency drives cisplatin resistance in non-small cell lung cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

LncRNA NAS1 缺失驱动非小细胞肺癌顺铂耐药

PRJNA1420689 是一个围绕非小细胞肺癌顺铂耐药机制建立的生物项目数据集,英文全称为“LncRNA NAS1 deficiency drives cisplatin resistance in non-small cell lung cancer”。该数据集聚焦于 lncRNA NAS1 缺失与非小细胞肺癌顺铂耐药之间的关系,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容主要涉及转录组或基因表达层面。数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库,本站将其归类于肿瘤 / 肺癌方向。整体来看,该数据集可用于研究 lncRNA 在肺癌化疗耐药过程中的表达变化,并为相关转录组分析提供数据基础,适合关注非小细胞肺癌耐药机制、lncRNA 功能以及基因表达调控的研究人员参考使用。

【数据集背景】

非小细胞肺癌是肺癌的主要类型之一,顺铂是临床常用的化疗药物,但耐药问题常导致治疗效果受限。该数据集以“LncRNA NAS1 deficiency drives cisplatin resistance in non-small cell lung cancer”为主题,说明其研究背景集中在 lncRNA NAS1 缺失如何驱动非小细胞肺癌对顺铂产生耐药。长链非编码 RNA(lncRNA)在基因表达调控中具有重要作用,近年来在肿瘤发生、发展及化疗耐药中的功能受到广泛关注。该数据集正是围绕这一研究方向,通过 BioProject 形式组织相关生物学数据,帮助用户从转录组或基因表达角度理解 NAS1 缺失与顺铂耐药之间的关联。源站描述指出,BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的生物学数据集合,并为用户提供统一入口以查找该项目产生的多种数据类型。因此,该数据集可视为一个项目级资源,用于汇聚与上述研究主题相关的数据链接和记录。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。结合标题和短描述可知,数据围绕非小细胞肺癌中 NAS1 缺失与顺铂耐药关系展开,可用于研究 lncRNA 在肺癌化疗耐药中的表达变化及相关转录组分析。源站未提供具体的样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表或分析结果等细节。因此,关于数据的具体组成、文件格式、数据量大小以及是否包含原始测序数据或处理后数据,源站未提供。用户若需了解更详细的数据内容,应访问 NCBI BioProject 中该项目的记录页面,查看其链接的各类数据资源。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 的 BioProject 数据库。项目英文名中包含 BioProject ID 1420689,源站标题也标注了“ID 1420689 - BioProject - NCBI”。源站描述说明,BioProject 记录来自单一组织或联盟,围绕单一研究计划收集相关生物学数据,并提供统一入口链接到该项目产生的不同数据类型。关于该数据集的具体采集方法、实验设计、样本来源、伦理审批信息、测序策略或数据处理流程,源站未提供。本站分类为肿瘤 / 肺癌,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,这些信息可用于初步判断其所属领域和数据类型,但更详细的采集与来源信息需以 NCBI 项目页面为准。

【适用场景】

该数据集适用于非小细胞肺癌化疗耐药相关研究,尤其是关注 lncRNA NAS1 缺失与顺铂耐药关系的课题。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,其可能适用于转录组分析、基因表达差异研究、lncRNA 功能注释以及耐药机制探索等场景。研究人员可将其作为项目级入口,查找与 NAS1 缺失和顺铂耐药相关的表达数据,进而开展下游分析或验证实验。此外,该数据集也可用于肺癌生物标志物发现、化疗敏感性机制研究以及 lncRNA 在肿瘤耐药中的调控网络分析等方向。但具体适用性取决于该项目实际提供的数据类型和内容,源站未提供详细说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该项目记录,项目英文名中包含 PRJNA1420689,源站标题中标注了 ID 1420689。BioProject 记录提供统一入口,用户可从中找到链接的多种数据类型。关于如何下载、解析或分析该数据集的具体步骤,源站未提供。通常,BioProject 页面会链接到相关数据资源,但本数据集的实际数据文件、访问方式、是否需要申请权限以及使用工具等,源站未提供。建议用户直接访问 NCBI 对应项目页面获取最新信息。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公开数据库记录,但源站未提供关于数据质量、完整性、准确性或验证情况的具体说明。由于缺乏样本数量、测序深度、重复次数、统计方法等细节,无法评估其数据质量或结论可靠性。此外,该数据集为项目级记录,可能仅提供数据链接而非直接可用的分析结果。用户在使用时应注意,源站未提供具体限制说明,包括是否存在使用范围、隐私或伦理限制等。因此,在开展研究前,应仔细查阅 NCBI 项目页面及相关数据文件,以确认其适用性和局限性。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目英文名中包含 PRJNA1420689,源站标题中标注了 ID 1420689。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息,源站未提供。用户在使用或引用时,应遵循 NCBI 及 BioProject 数据库的相关规定,并查阅项目页面获取准确的引用要求。由于源站未提供具体许可信息,建议用户直接访问 NCBI 页面确认。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1420689

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

顺铂耐药仍然是非小细胞肺癌(NSCLC)治疗中的主要障碍。长链非编码RNA(lncRNA)已被认为与化疗耐药有关,但其具体作用和机制尚未完全阐明。本研究发现,lncRNA NAS1的低表达通过NR2F1介导的TGFB1/NF-κB信号通路驱动NSCLC的顺铂耐药。总体设计:对三种不同的顺铂耐药NSCLC细胞系(H226/DDPr、H460/DDPr、PC9/DDPr)及其相应的亲本细胞进行总RNA-seq分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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