PRJNA1416776：β-Lapachone 拮抗泛素特异性蛋白酶 18 活性以产生抗肿瘤效应
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1416776），主题为转录组或基因表达，属于肿瘤/肺癌方向。项目围绕 β-Lapachone 拮抗泛素特异性蛋白酶 18（USP18）活性并由此产生抗肿瘤效应这一研究主题，汇集了与该项目相关的多种类型生物学数据链接
基本信息
资源简介
PRJNA1416776：β-Lapachone 拮抗泛素特异性蛋白酶 18 活性以产生抗肿瘤效应
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1416776），英文名称为“PRJNA1416776: β-Lapachone Antagonizes Ubiquitin-Specific Protease 18 Activity to Elicit Anti-Neoplastic Effects”，源站标题为“β-Lapachone Antagonizes Ubiquitin-Specific Proteas... (ID 1416776) - BioProject - NCBI”。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类归入肿瘤 / 肺癌方向。项目围绕 β-Lapachone 拮抗泛素特异性蛋白酶 18（USP18）活性并由此产生抗肿瘤效应这一研究主题，汇集了与该项目相关的多种类型生物学数据链接。BioProject 作为生物数据集合，通常用于将同一项研究计划下产生的不同类型数据集中呈现，便于用户从一个入口查找和访问相关数据资源。
【数据集背景】
该数据集所属的 BioProject 记录来自 NCBI，项目编号为 1416776。其研究主题聚焦于 β-Lapachone 与泛素特异性蛋白酶 18（USP18）活性之间的拮抗关系，以及由此引发的抗肿瘤效应。从本站分类来看，该数据集被归入肿瘤 / 肺癌方向，说明其研究背景与肿瘤学，尤其是肺癌相关领域存在关联。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的生物学数据集合，BioProject 记录为用户提供了一个统一入口，用于查找该项目所产生的多种数据类型。因此，该数据集并非单一实验或单一数据表，而是一个项目级别的数据组织单元，承载着与上述研究主题相关的数据链接。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容与转录组或基因表达相关。项目围绕 β-Lapachone 拮抗 USP18 活性并产生抗肿瘤效应这一主题，汇集了与该项目相关的多种类型生物学数据链接。源站未提供具体的数据文件类型、样本数量、基因列表、表达矩阵或分析结果等细节。因此，关于数据内容的具体构成，例如包含哪些样本、采用何种测序平台、产生了多少原始数据量等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）。其记录形式为 BioProject，项目编号为 1416776。根据源站描述，BioProject 记录来自单一组织或联盟，用于汇集与单一研究计划相关的生物学数据。源站未提供具体的采集方法、实验设计、样本来源、采集时间、地理范围或伦理审批等信息。
【适用场景】
基于该数据集的主题标签“Transcriptome or Gene expression”以及本站分类“肿瘤 / 肺癌”，其潜在适用场景可能包括：转录组或基因表达相关的数据探索、肿瘤尤其是肺癌方向的基因表达研究背景调研、以及围绕 β-Lapachone 与 USP18 活性拮抗关系及抗肿瘤效应的项目级数据检索。由于该数据集为 BioProject 记录，适合用于查找与该项目相关的多种数据类型链接，而非直接作为单一分析数据集使用。源站未提供更具体的适用场景说明。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 记录进行访问，项目编号为 1416776。用户可通过 BioProject 记录这一统一入口，查找该项目所产生的多种数据类型链接。源站未提供具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具要求等信息。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 记录，其质量与限制取决于源站所汇集的具体数据链接和项目内容。源站未提供关于数据质量评估、完整性、准确性、偏差或技术限制的具体说明。此外，由于该记录为项目级集合，用户在使用时需注意其并非单一实验数据，具体数据质量需参考各链接指向的原始数据记录。源站未提供相关限制信息。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用条款等信息。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 源站的相关政策与要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1416776
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
去泛素化酶（DUB）泛素特异性蛋白酶18（USP18）是一个抗肿瘤靶点。需要USP18抑制剂。为满足这一未满足的需求，我们设计了一种具有酶活性的人重组USP18蛋白，用于高通量筛选。筛选发现β-拉帕醌是USP18-ISG15活性的抑制剂。独立使用β-拉帕醌处理小鼠和人肺癌细胞系，统计学显著降低了增殖并增加了凋亡。USP18表达的获得抵消了这些效应。β-拉帕醌处理统计学显著抑制了无胸腺小鼠中H1299人肺癌异种移植瘤的生长，以及移植了小鼠344SQ肺癌的同系小鼠中的生长。β-拉帕醌增加了活性氧（ROS），但抗肿瘤效应在ROS产生很少的浓度下即可发生。ROS清除剂处理未能挽救抗癌效应，表明参与了一种不依赖ROS的抗肿瘤机制。为确定这一点，使用了干扰素刺激反应元件（ISRE）报告基因试验。β-拉帕醌处理激活了该报告基因活性，符合USP18抑制剂的预期。
β-拉帕醌处理增加了整体ISG15结合。蛋白质组学分析和免疫沉淀实验揭示了已知和新的ISG15化蛋白。对有无USP18表达增益的 parental 肺癌细胞进行RNA测序，发现了β-拉帕醌处理后的差异表达基因和通路。综上所述，β-拉帕醌是一种新型USP18抑制剂和癌症生物学工具。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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