基于标记的筛选鉴定ASCL1和POU2F1为小细胞肺癌中DLL3表达的转录共调控因子[RNA-Seq]
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1416293），主题为转录组或基因表达，属于肿瘤/肺癌分类。研究通过基于标志物的筛选，鉴定 ASCL1 和 POU2F1 作为小细胞肺癌中 DLL3 表达的转录共调控因子，数据由 RNA-Seq 产生
![PRJNA1416293: Marker-based screens identify ASCL1 and POU2F1 as transcriptional coregulators of DLL3 expression in small cell lung cancer [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/106263.jpg)
基本信息
资源简介
基于标记的筛选鉴定ASCL1和POU2F1为小细胞肺癌中DLL3表达的转录共调控因子[RNA-Seq]
该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA-Seq 项目（ID 1416293），英文名称为“Marker-based screens identify ASCL1 and POU2F1 as transcriptional coregulators of DLL3 expression in small cell lung cancer [RNA-Seq]”。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类归入肿瘤/肺癌。研究围绕小细胞肺癌展开，通过基于标志物的筛选策略，鉴定 ASCL1 与 POU2F1 作为 DLL3 表达的转录共调控因子，相关数据由 RNA-Seq 技术产生。该数据集为研究者了解小细胞肺癌中 DLL3 表达调控机制提供了转录组层面的数据资源，可用于探索 ASCL1、POU2F1 与 DLL3 之间的调控关系。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，源站标题为“Marker-based screens identify ASCL1 and POU2F1 as ... (ID 1416293) - BioProject - NCBI”。BioProject 是围绕某一项研究计划而汇集生物数据的集合，通常来自单一机构或联合体；一条 BioProject 记录为用户提供统一入口，以便找到该项目所产生的多种数据类型。本项目聚焦于小细胞肺癌，研究目标是通过基于标志物的筛选，识别 ASCL1 和 POU2F1 作为 DLL3 表达的转录共调控因子。主题标签表明其数据属于转录组或基因表达范畴。
【数据内容】
该数据集的核心内容为 RNA-Seq 数据，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。研究通过基于标志物的筛选，鉴定 ASCL1 和 POU2F1 作为小细胞肺癌中 DLL3 表达的转录共调控因子。数据由 RNA-Seq 产生，属于肿瘤/肺癌分类。关于样本数量、测序深度、具体基因列表、差异表达结果等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，收录于 NCBI BioProject，项目 ID 为 1416293。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合，来自单一机构或联合体，并为用户提供查找该项目多种数据类型的统一入口。关于具体的采集机构、实验地点、采集时间、样本处理流程等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组或基因表达相关研究，尤其是小细胞肺癌中 DLL3 表达调控机制的研究。由于研究涉及 ASCL1 和 POU2F1 作为 DLL3 表达的转录共调控因子，该数据可用于探索这些因子在小细胞肺癌中的调控作用。此外，该数据集归入肿瘤/肺癌分类，可供肿瘤生物学、肺癌分子机制等方向的研究参考。关于具体的分析应用场景、可支持的假设检验类型等，源站未提供。
【使用方法】
该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA-Seq 项目，用户可通过 BioProject 记录查找该项目所链接的多种数据类型。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具建议等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，源站描述说明 BioProject 记录提供用户查找项目相关多种数据类型的统一入口。关于数据质量评估指标、测序质量、样本量、批次效应、技术限制等具体信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，收录于 NCBI BioProject，项目 ID 为 1416293。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1416293
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们进行了CRISPR筛选，鉴定出POU2F1是SCLC中DLL3表达的一种新型转录调控因子。我们采用遗传学和表观基因组学方法验证了POU2F1和ASCL1可激活DLL3表达以及神经内分泌谱系转录程序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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