PRJNA1414502：呼吸道病毒感染促进肺癌加速生长的单细胞RNA测序数据
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1414502），主题为呼吸道病毒感染促进肺癌加速生长的单细胞RNA测序研究，属于肿瘤/肺癌方向
![PRJNA1414502: Respiratory viral infections prime accelerated lung cancer growth [scRNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/106317.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA1414502：呼吸道病毒感染促进肺癌加速生长的单细胞RNA测序数据
该数据集为 NCBI BioProject 收录的单细胞 RNA 测序项目，编号 1414502，英文名称为“PRJNA1414502: Respiratory viral infections prime accelerated lung cancer growth [scRNA-Seq]”。从名称可以看出，该项目围绕呼吸道病毒感染与肺癌加速生长之间的关系展开，采用单细胞 RNA 测序技术获取转录组层面的基因表达信息。数据集在分类上归属于肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其核心数据为基因表达相关的高通量测序结果。该项目的源站为 ncbi.nlm.nih.gov，用户可通过 BioProject 记录集中获取与该项目相关的多种数据类型链接，从而定位原始数据与分析资源。整体而言，该数据集适合用于探索病毒感染背景下肺部肿瘤微环境、细胞异质性及基因表达调控变化等研究方向。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1414502。BioProject 是围绕某一项研究计划或倡议而汇集的一组生物学数据，通常由单一机构或联盟发起。一个 BioProject 记录为用户提供统一入口，用于查找该项目所产生的多种数据类型及其相关链接。本项目聚焦于呼吸道病毒感染与肺癌加速生长之间的关联，属于肿瘤 / 肺癌研究领域，并采用单细胞 RNA 测序作为主要技术手段。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明项目产生的数据主要涉及转录组或基因表达层面。
【数据内容】
该数据集的核心内容为单细胞 RNA 测序数据，对应英文名称中的“[scRNA-Seq]”。项目主题为呼吸道病毒感染促进肺癌加速生长的研究，因此数据应反映在病毒感染条件下肺部肿瘤相关细胞的基因表达特征。主题标签“Transcriptome or Gene expression”进一步表明，数据内容属于转录组或基因表达范畴。源站描述仅对 BioProject 的性质作出通用说明，未提供该数据集具体的样本数量、细胞数目、测序深度、基因数量或分析结果等细节。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Respiratory viral infections prime accelerated lun... (ID 1414502) - BioProject - NCBI”。项目编号为 1414502，英文名称为“PRJNA1414502: Respiratory viral infections prime accelerated lung cancer growth [scRNA-Seq]”。BioProject 记录本身是相关生物学数据的集合，来源于单一机构或联盟，并提供统一入口以链接该项目产生的多种数据类型。关于具体的样本采集地点、时间、物种、细胞类型、实验条件及测序平台等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤 / 肺癌方向的研究，尤其是围绕呼吸道病毒感染与肺癌加速生长之间关系的探索。由于采用单细胞 RNA 测序，可用于分析肺部肿瘤组织或相关样本中不同细胞类型的基因表达谱，进而研究细胞异质性、细胞亚群组成以及病毒感染对肿瘤微环境的潜在影响。主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明其适合转录组水平的数据挖掘与基因表达分析。此外，该数据集也可作为 BioProject 记录，用于查找和链接同一项目下的其他数据类型。具体适用场景的细节，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 1414502）访问该数据集。BioProject 记录提供统一入口，用于查找与该项目相关的多种数据类型及其链接。用户可依据记录中的链接定位原始测序数据、转录组数据或其他相关资源。由于该数据集标注为单细胞 RNA 测序，使用者通常需要具备单细胞转录组数据分析的基本能力，包括数据下载、质控、比对、表达定量、细胞聚类与注释等通用流程。关于该数据集的具体使用步骤、推荐工具或分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共数据库收录的项目记录。BioProject 作为数据集合，提供统一入口以链接多种数据类型，但其记录本身不必然包含完整的质量控制指标或分析结论。该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，数据类型为单细胞 RNA 测序。关于该数据集的具体质量评估、批次效应、测序深度、细胞存活率、数据完整性或潜在偏差等信息，源站未提供。使用者应在分析前自行评估数据质量，并注意源站未提供相关限制说明。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1414502，英文名称为“PRJNA1414502: Respiratory viral infections prime accelerated lung cancer growth [scRNA-Seq]”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息，源站未提供。使用者应参考 NCBI BioProject 的通用引用规范及源站相关页面获取授权与引用要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1414502
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
COVID-19大流行凸显了病毒性肺炎的长期健康后果，但其对癌症发生和进展的影响仍知之甚少。在此，我们发现先前的SARS-CoV-2或流感感染通过重编程局部免疫景观加速肺肿瘤进展。为明确感染诱导肿瘤促进的机制，我们对肿瘤诱导后6周（PBS_T6、IAV_T6）和12周（PBS_T12、IAV_T12）的KP小鼠全肺细胞进行了单细胞RNA测序，并设置了无肿瘤的PBS和IAV对照（与T6时间匹配）。在所有条件下，scRNA-seq揭示先前的病毒性肺炎编程了一个促肿瘤肺微环境，其特征是促肿瘤髓系程序增加和抗肿瘤CD8+ T细胞免疫减弱。值得注意的是，我们鉴定出一个占主导地位的SiglecF^hi肿瘤相关中性粒细胞亚群，该亚群在感染肿瘤中富集，表现出缺氧/糖酵解和免疫抑制相关的转录程序，并显示出与祖细胞和肿瘤上皮细胞群最强的预测相互作用。总体设计：感染IAV 3周的KP小鼠经i.t.
给予Ad5-SPC-Cre病毒以诱发肺肿瘤发生。在肿瘤诱导后第6周（早期）和第12周（晚期），制备肺单细胞悬液，用于scRNA-Seq分析。无肿瘤的PBS处理和IAV处理小鼠作为对照。每组代表来自3-5只小鼠的混合样本。单细胞文库采用Chromium Single Cell 3′ Reagent Kit（10x Genomics）按照制造商说明制备。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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