PRJNA1401891：用Trikine免疫疗法从细胞表面重编程STAT信号

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1401891

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞因子通过使两条受体链二聚化来激活Janus激酶和STAT转录因子，从而调控免疫细胞，但存在治疗上的缺陷。我们设计了“Trikines”，强制在细胞表面顺式形成三链细胞因子受体复合物，诱导定制的STAT转录信号程序，以优化治疗效果。设计的Trikines通过组装白介素-2（IL-2）、白介素-10（IL-10）和白介素-21（IL-21）受体的三聚体组合，共同激活了不同于任何天然细胞因子的pSTAT5和pSTAT3特征。基于IL-2的Trikine限制了T细胞的终末分化，促进了干性，并增强了肿瘤控制的持久性，且无毒性。出乎意料的是，基于IL-10的Trikine诱导了免疫细胞浸润到免疫原性差的肿瘤中，在小细胞肺癌和胰腺癌模型中显示出显著疗效。Trikines消除了为免疫疗法定制STAT特征所需的细胞工程。总体设计：小鼠皮下接种2.5×10^5个6694c2vTRP1细胞，并接受腹腔注射。

每隔一天注射PBS、单链IL-10（每只小鼠26微克，n=5）或IL-10/2-Trikine（每只小鼠30.6微克，n=5），从第8天开始，总共注射两次。第14天处死小鼠。通过磁珠分离CD45⁺肿瘤浸润淋巴细胞，用 hashtag 抗体单独标记，按治疗组混合，并进行单细胞5’ RNA和细胞表面蛋白测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。