PRJNA1379439：FOXA1促进SCLC化疗耐药[RNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1379439

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小细胞肺癌（SCLC）是一种侵袭性神经内分泌肿瘤。尽管化疗一直是一线治疗的基石，但大多数SCLC患者在初始缓解后不久即产生化疗耐药，而这种耐药的分子基础仍知之甚少。在此，我们确定FOXA1是SCLC中一个频繁扩增且表达上调的基因，FOXA1高表达与不良预后相关。我们进一步证明，FOXA1过表达促进化疗耐药。在机制上，我们揭示WNT5A是FOXA1的下游靶点，通过激活Wnt/β-catenin通路介导化疗耐药。FOXA1还诱导SCLC细胞发生上皮-间质转化（EMT），且FOXA1高表达的人SCLC肿瘤表现出富集的EMT和Wnt/β-catenin通路特征。重要的是，药物抑制Wnt通路可选择性地抑制FOXA1过表达SCLC细胞的生长。总之，我们的研究确定FOXA1是SCLC化疗耐药的关键驱动因素，并强调Wnt通路抑制是克服FOXA1驱动化疗耐药的一种有前景的策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。