PRJNA1369873：IL10 Trikine 的 scRNAseq 数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1369873

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞因子通过使两条受体链二聚化来激活Janus激酶和STAT转录因子，从而调控免疫细胞，但存在治疗上的缺陷。我们设计了“Trikines”，迫使细胞因子受体三链复合物在细胞表面发生顺式形成，从而诱导量身定制的STAT转录信号程序，并针对治疗效果进行优化。所设计的Trikines通过组装白细胞介素-2（IL-2）、白细胞介素-10（IL-10）和白细胞介素-21（IL-21）受体的三聚体组合，共同激活了不同于任何天然细胞因子的pSTAT5和pSTAT3特征。基于IL-2的Trikines抑制T细胞的终末分化，促进干性，并增强肿瘤控制的持久性。出乎意料的是，一种基于IL-10的Trikine诱导免疫细胞浸润到免疫原性较差的肿瘤中，在小细胞肺癌和胰腺癌模型中显示出显著疗效。Trikines无需细胞工程即可为免疫治疗定制STAT特征。总体设计：F1小鼠皮下接种5×10⁵个KP1细胞，并接受腹腔注射。

从第7天到第19天，每隔一天给予单IL-10(10)或IL-10/2-Trikine（trikine，每剂3 μg功能性细胞因子），并在第7、11、15和19天给予抗PD-1抗体（Combo，每剂200 μg，克隆号RMP1-14）。第19天处死小鼠并收集肿瘤。使用Ficoll-Paque PLUS（Cytiva）通过密度梯度离心富集肿瘤浸润白细胞，随后进行表面标志物和DAPI染色（Thermo Fisher Scientific）。使用Sony SH800细胞分选仪（Sony Biotechnology）分选活的CD45⁺白细胞，用于单细胞RNA测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。