PRJNA1369374：Trikine免疫疗法重编程细胞表面STAT信号[IL21 Trikine的scRNAseq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1369374

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞因子通过使两条受体链二聚化来激活Janus激酶和STAT转录因子，从而调控免疫细胞，但存在治疗上的局限性。我们设计了“Trikines”，迫使三条链细胞因子受体复合物在细胞表面发生顺式形成，从而诱导量身定制的STAT转录信号程序，并针对治疗效力进行优化。所设计的Trikines通过组装白细胞介素-2（IL-2）、白细胞介素-10（IL-10）和白细胞介素-21（IL-21）受体的三聚体组合，共同激活了不同于任何天然细胞因子的pSTAT5和pSTAT3特征信号。基于IL-2的Trikines可抑制T细胞的终末分化，促进干性，并增强肿瘤控制的持久性。出乎意料的是，一种基于IL-10的Trikine可诱导免疫细胞浸润进入免疫原性较差的肿瘤，在小细胞肺癌和胰腺癌模型中显示出显著疗效。Trikines无需细胞工程即可为免疫治疗定制STAT特征信号。

总体设计：在B16F10+pmel ACT模型中，针对super IL-2(2)、sIL-2+IL-21（2Pos21）或IL-2/21-trikine（2-trikine）治疗的低剂量方案，于肿瘤注射后第18天采集小鼠肿瘤。将肿瘤切碎并使用gentleMACS Octo Dissociator解离。通过Sony Cell Sorter SH800S分选活细胞、单细胞、Thy1.1+CD8+细胞，收集TILs用于测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。