PRJNA1368629：Rab37介导的OPN分泌通过自分泌–旁分泌信号富集SPP1+巨噬细胞驱动肺癌进展

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1368629

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数据说明

肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）是一种高度可塑的免疫细胞，能够塑造肿瘤微环境（TME）并影响癌症进展。然而，调控其功能异质性的分子决定因素仍未完全阐明。在本研究中，我们鉴定出Rab37是重塑肺TME中巨噬细胞状态的关键调控因子。单细胞RNA测序显示，Rab37野生型（WT）肿瘤中富集免疫抑制性Spp1+ TAMs，而Rab37敲除（KO）肿瘤中Thbs1+ TAMs比例更高，提示巨噬细胞编程发生了Rab37依赖性转变。在机制上，Rab37促进骨桥蛋白（OPN）分泌，后者激活STAT3信号通路，建立自分泌反馈环路，从而维持Spp1表达并诱导M2样极化。旁分泌OPN信号进一步促进肺癌细胞增殖、迁移和侵袭。在临床肺癌标本中，CD163+/Rab37+/OPN+ TAMs与复发和不良生存相关，多因素分析证实其具有独立预后价值。

这些发现共同表明，Rab37通过协调OPN/STAT3信号通路来调控巨噬细胞的表型和功能，从而强化免疫抑制性肿瘤微环境（TME）并促进肺癌进展。因此，靶向Rab37–OPN轴可能是一种有前景的治疗策略。总体设计：在肿瘤建立后14天，从注射Matrigel（Matrigel注射组）或肿瘤细胞（LLC注射组）的Rab37野生型（WT）和敲除型（KO）C57BL/6小鼠中分离CD45+免疫细胞。按照制造商说明，使用10x Genomics Chromium平台对单细胞悬液进行scRNA-seq。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。