胚胎干细胞因子DPPA2/4扩增非小细胞肺癌中的活性H3K4me3-H2AK119ub染色质结构域

整体设计:参见各Series。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖非小细胞肺癌。本数据集为肿瘤领域的其他公开数据集,来源:sra,主题涵盖非小细胞肺癌。

sra
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其他非小细胞肺癌胚胎干细胞因子DPPA2/4H3K4me3H2AK119ub染色质结构域SuperSeries
PRJNA1365224: Embryonic stem cell factors DPPA2/4 amplify active H3K4me3-H2AK119ub chromatin domains in non-small cell lung cancer

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

胚胎干细胞因子DPPA2/4扩增非小细胞肺癌中的活性H3K4me3-H2AK119ub染色质结构域

PRJNA1365224 是一个面向肿瘤研究领域的公开数据集,主题聚焦于非小细胞肺癌。该数据集围绕胚胎干细胞因子 DPPA2/4 在非小细胞肺癌中对活跃 H3K4me3-H2AK119ub 染色质结构域的放大作用展开,属于 SuperSeries 类型的数据集合,由若干 SubSeries 共同组成。其整体实验设计需参见各 SubSeries 的具体说明,源站未提供统一的整体设计描述。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,可供肺癌基础研究、表观遗传学分析等相关工作参考使用。

【数据集背景】

该数据集关注非小细胞肺癌中的表观遗传调控机制,特别是胚胎干细胞因子 DPPA2/4 与活跃染色质结构域 H3K4me3-H2AK119ub 之间的关系。从标题所反映的研究主题看,工作涉及胚胎干细胞因子在肿瘤背景下对特定染色质状态的放大效应,属于肿瘤表观遗传学与肺癌分子机制交叉的研究方向。数据集以 SuperSeries 形式组织,说明其由多个相关的子系列数据集合构成,各子系列可能对应不同的实验类型或分析角度,但源站未提供各子系列的具体构成说明。

【数据内容】

该数据集为 SuperSeries,由若干 SubSeries 组成,源站描述明确指出整体设计需参见各个 Series。因此,数据集的具体样本数量、测序类型、数据文件格式与规模等信息,源站未提供。就主题而言,数据内容应与非小细胞肺癌中 DPPA2/4 及 H3K4me3-H2AK119ub 染色质结构域相关,但清单未给出具体的数据类型与内容细节。

【采集与来源】

数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,以 PRJNA1365224 为标识。源站描述说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,整体设计参见各个 Series。除来源站点与数据集标识外,样本采集地点、采集时间、物种背景、细胞系或临床样本信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤领域特别是非小细胞肺癌相关的研究场景,可用于探讨胚胎干细胞因子 DPPA2/4 与活跃 H3K4me3-H2AK119ub 染色质结构域之间的调控关系。由于其为 SuperSeries 结构,使用时可结合各 SubSeries 分别开展分析。具体的适用分析类型与方法,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,应首先查阅其所包含的各个 SubSeries,因为整体设计需参见各个 Series。用户可根据研究目的选择相应的子系列数据进行分析。数据下载方式、文件组织格式、预处理流程与分析工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集,来源为 ncbi.nlm.nih.gov。由于整体设计需参见各 SubSeries,使用者在分析前需自行核对各子系列的设计与数据质量。数据集的具体质量控制指标、批次信息、样本量及潜在偏倚等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,标识为 PRJNA1365224。具体的引用方式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1365224

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below. Overall design: Refer to individual Series

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