PRJNA1169058：肺肿瘤微环境中肿瘤分期驱动的NK细胞成熟与细胞毒性功能破坏

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1169058

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

自然杀伤（NK）细胞在对抗癌症中发挥着关键作用，既可直接杀伤恶性细胞，也可通过分泌细胞因子和趋化因子促进适应性免疫应答。在肺部肿瘤微环境（TME）中，NK细胞数量稀少且功能失调，但其潜在机制仍不清楚。通过对肺部肿瘤进行单细胞转录组分析并探索拟时序，我们发现TME以肿瘤分期依赖的方式破坏了NK细胞的成熟轨迹，最终导致细胞毒性亚群的选择性排斥。利用功能实验，我们观察到瘤内NK细胞死亡以及细胞毒性能力的下降均取决于肿瘤分期。最后，我们对肺癌人类公共数据集的分析印证了这些发现，揭示了肿瘤进展过程中NK细胞存在平行的功能失调性成熟过程。这些结果突出了肿瘤细胞逃避NK细胞细胞毒性的新机制，从而为定制化治疗策略铺平了道路。总体设计：处死携带小肿瘤或大肿瘤的小鼠（见材料与方法）。

本单细胞实验分析了肺部肿瘤部分及非肿瘤对应部分 *************************************************************** 提交者表示缺失的原始文件是由于文件丢失所致。 ***************************************************************

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。