PRJNA1164243：TRIM22敲低与对照A549细胞有无电离辐射处理的RNA-seq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1164243

标准获取流程：

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数据说明

在本研究中，我们探讨了TRIM22在A549人肺癌细胞对电离辐射(IR)应答中的作用。使用shRNA在A549细胞中稳定敲低TRIM22，并建立了四个实验组：对照A549细胞(未照射)、对照A549细胞(照射)、TRIM22敲低A549细胞(未照射)和TRIM22敲低A549细胞(照射)。进行RNA测序(RNA-seq)以识别与TRIM22敲低和照射相关的基因表达变化。该数据集为深入了解TRIM22影响细胞对辐射应答的分子机制及其对癌症治疗的潜在影响提供了见解。总体设计：实验旨在研究TRIM22敲低对A549细胞在电离辐射后基因表达谱的影响。A549细胞被稳定转染了靶向TRIM22的shRNA或对照shRNA。

实验包括四组：(1) 未接受照射的对照A549细胞，(2) 接受照射的对照A549细胞，(3) 未接受照射的TRIM22敲低A549细胞，(4) 接受照射的TRIM22敲低A549细胞。每组包括三个生物学重复，共计12个样本。从所有12个样本中提取RNA并进行RNA测序，以比较TRIM22敲低和电离辐射诱导的转录组变化。该设计有助于分析TRIM22在细胞对辐射应答中的特定作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。