PRJDB18314：单株肺癌细胞系靶向序列
单细胞靶向序列使用日本产业医科大学第二外科拥有的细胞系进行。每株细胞系均收集为单细胞，提取DNA并进行靶向测序。单细胞测序结果与各细胞系bulk测序获得的参考序列进行比较
基本信息
资源简介
PRJDB18314：单株肺癌细胞系靶向序列
PRJDB18314 是一个聚焦肺癌单细胞靶向序列的数据集，收录于本站肿瘤/肺癌分类，来源为 ebi.ac.uk。该数据集的核心工作是在日本产业医科大学第二外科所拥有的肺癌细胞系上开展单细胞水平的靶向测序：研究者选取 PC9、NCI-H441 和 NCI-H1975 三株细胞系，将每株细胞系收集为单细胞，提取 DNA 后进行靶向测序，并将单细胞测序结果与各细胞系经 bulk（批量）测序获得的参考序列进行比较。这一设计使得同一细胞系内部单细胞层面的靶向序列信息能够与群体水平的参考序列形成对照，为观察细胞系内单细胞间的序列差异提供了数据基础。数据集英文名称为“Target sequence in a single lung cancer cell line.”，整体围绕肺癌细胞系的单细胞靶向测序展开。
【数据集背景】
该数据集属于肿瘤/肺癌研究方向，关注的是肺癌细胞系在单细胞分辨率下的靶向序列特征。研究使用的细胞系为 PC9、NCI-H441 和 NCI-H1975，均由日本产业医科大学第二外科拥有。数据集的出发点在于：常规的细胞系测序通常以批量细胞为对象，得到的是群体平均的序列信息；而单细胞靶向测序能够把测序对象细化到单个细胞，从而在更精细的尺度上考察靶向区域的序列情况。将单细胞结果与同一细胞系的 bulk 参考序列进行比对，构成了该数据集的基本研究框架。
【数据内容】
数据集的内容为单细胞靶向序列。具体而言，针对 PC9、NCI-H441 和 NCI-H1975 三株细胞系，每株细胞系均收集为单细胞，随后对每个单细胞提取 DNA 并实施靶向测序，由此获得单细胞层面的靶向序列数据。与此同时，各细胞系还通过 bulk 测序获得了参考序列，用于与单细胞测序结果进行比较。因此，数据集同时涉及单细胞靶向测序结果与细胞系 bulk 参考序列两类信息，二者共同构成比较分析的基础。关于靶向区域的具体基因列表、测序读长、细胞数量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 ebi.ac.uk。样本为日本产业医科大学第二外科拥有的三株肺癌细胞系 PC9、NCI-H441 和 NCI-H1975。采集流程为：将每株细胞系收集为单细胞，提取 DNA，进行靶向测序；同时对各细胞系进行 bulk 测序以获得参考序列。单细胞测序结果随后与这些参考序列进行比较。关于样本采集的时间、地点、伦理审批及具体实验平台等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌细胞系单细胞水平靶向序列的研究场景，例如考察同一细胞系内不同单细胞之间在靶向区域上的序列异同，或将单细胞测序结果与细胞系 bulk 参考序列进行对照分析。由于涉及 PC9、NCI-H441 和 NCI-H1975 三株细胞系，也可用于围绕这几株细胞系开展的单细胞测序方法学比较与验证工作。关于该数据集在其他具体研究中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
使用时可将单细胞靶向测序结果与对应细胞系的 bulk 参考序列进行比对，以观察单细胞层面与群体层面序列信息之间的关系。由于数据集包含三株不同细胞系，分析时可按细胞系分别组织单细胞数据与参考序列。关于数据文件的具体格式、下载方式与处理流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于细胞系而非临床肿瘤样本，研究对象为 PC9、NCI-H441 和 NCI-H1975 三株细胞系，其结果的外推范围受此限定。单细胞靶向测序涉及单细胞收集与 DNA 提取等步骤，相关技术细节与质控指标源站未提供。关于数据规模、覆盖度、重复次数及潜在偏差等信息，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与使用许可，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB18314
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
单细胞靶序列检测使用日本职业与环境健康大学第二外科拥有的细胞系进行。我们使用了PC9、NCI-H441和NCI-H1975细胞系。每种细胞系均收集单细胞，提取DNA并进行靶序列测序。单细胞测序结果与每种细胞系批量测序获得的参考序列进行了比较。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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