复发小细胞肺癌进展基因组学

源站描述为 dbGaP study (Case Set),即一项以病例集合形式组织的 dbGaP 研究。数据聚焦复发小细胞肺癌进展的基因组学,可用于探索复发与进展相关的基因组特征,支持分类等分析任务(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Case Set
phs001049: Genomics of Relapsed Small Cell Lung Cancer Progression

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

复发小细胞肺癌进展基因组学

phs001049: Genomics of Relapsed Small Cell Lung Cancer Progression 是一个聚焦于复发小细胞肺癌进展的基因组学研究数据集,收录于 NCBI 的 dbGaP 平台,在本站归类于肿瘤 / 肺癌方向。该研究以病例集合(Case Set)的形式组织,围绕小细胞肺癌在治疗后复发并进展这一临床难题,提供相应的基因组学数据资源。小细胞肺癌是一种侵袭性强、易复发、预后较差的肺癌亚型,其复发与进展的分子机制是临床与基础研究关注的重点。该数据集可用于探索与复发和进展相关的基因组特征,并支持分类等分析任务,为相关研究提供数据基础。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

小细胞肺癌是肺癌中恶性程度较高的类型,患者在接受初始治疗后往往面临复发和疾病进展的问题,而复发后的治疗选择有限、预后不佳。理解复发与进展过程中基因组层面的变化,对于揭示耐药机制、寻找潜在生物标志物以及探索新的干预策略具有重要意义。该数据集正是围绕“复发小细胞肺癌进展的基因组学”这一主题建立,旨在为相关研究提供病例集合形式的基因组数据支持。其研究定位属于肿瘤基因组学与肺癌临床问题交叉的范畴,服务于对复发与进展机制的探索。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Case Set,即以病例集合的形式组织数据。其核心内容聚焦于复发小细胞肺癌进展相关的基因组学信息。关于具体的样本数量、测序平台、数据类型(如全基因组、全外显子或转录组等)、变异类型及临床注释字段等细节,源站未提供。因此,本数据集在内容层面的可确认信息为:它是一项以病例集合形式组织的、围绕复发小细胞肺癌进展的基因组学研究资源,可用于探索复发与进展相关的基因组特征,并支持分类等分析任务。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,具体为 dbGaP 研究(Case Set)。dbGaP 是美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的基因型与表型数据库,用于归档和分发与基因型—表型关系相关的研究数据。该数据集作为其中一项研究收录,其原始描述即为 dbGaP study (Case Set)。关于样本采集地点、采集时间、纳入与排除标准、伦理审批信息以及具体的测序或实验流程等,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与组织形式,该数据集适用于以下方向:探索复发小细胞肺癌进展相关的基因组特征;开展与复发、进展相关的分类等分析任务;作为肿瘤基因组学研究中关于肺癌复发机制的参考数据资源。由于数据以病例集合形式组织,适合用于以病例为对象的基因组特征分析与模式识别研究。关于更具体的适用分析类型或建模任务,源站未提供。

【使用方法】

该数据集托管于 NCBI 的 dbGaP 平台,通常需要通过该平台的相应访问流程获取和使用。关于本数据集的具体下载方式、访问权限级别、是否需要申请审批、数据格式与配套文档等,源站未提供。使用者在开展分析前,应依据 dbGaP 平台的一般规范确认访问条件与数据使用要求。

【质量与限制】

该数据集为 dbGaP 收录的研究数据,其来源平台具有一定的规范性与权威性。但关于本数据集的具体样本规模、数据完整性、测序深度、质控指标以及潜在偏倚等质量相关信息,源站未提供。此外,由于数据以病例集合形式组织,可能不包含对照组信息,这在开展对比性分析时需加以考虑;但关于是否存在对照及具体设计,源站未提供。使用者应结合自身研究目的评估其适用性。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台。关于本数据集的具体引用格式、文献出处、数据使用协议、许可条款及访问限制等,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应遵循 dbGaP 平台的相关规定,并依据源站提供的正式信息完成引用与合规使用。

下载信息

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暂未开放

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001049

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case Set).

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