基于标志物的筛选鉴定ASCL1和POU2F1为小细胞肺癌DLL3表达的转录共调控因子[CRISPR筛选]
我们进行了 CRISPR 筛选，以鉴定 POU2F1 为 SCLC 中 DLL3 表达的新型转录调控因子。我们使用遗传学和表观基因组学方法验证了 POU2F1 和 ASCL1 可激活 DLL3 表达以及神经内分泌谱系转录程序
![GSE317998: Marker-based screens identify ASCL1 and POU2F1 as transcriptional coregulators of DLL3 expression in small cell lung cancer [CRISPR Screen]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/67741.jpg)
基本信息
资源简介
基于标志物的筛选鉴定ASCL1和POU2F1为小细胞肺癌DLL3表达的转录共调控因子[CRISPR筛选]
GSE317998 是一个基于 CRISPR 筛选的小细胞肺癌研究数据集，全称为“Marker-based screens identify ASCL1 and POU2F1 as transcriptional coregulators of DLL3 expression in small cell lung cancer [CRISPR Screen]”。该数据集聚焦于小细胞肺癌（SCLC）中 DLL3 表达的转录调控机制，通过 CRISPR 筛选技术鉴定出 POU2F1 是 DLL3 表达的新型转录调控因子，并进一步结合遗传学与表观基因组学方法，验证了 POU2F1 与 ASCL1 共同激活 DLL3 表达以及神经内分泌谱系转录程序。该数据集属于肿瘤/肺癌研究领域，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），为研究小细胞肺癌的分子机制、转录调控网络以及潜在治疗靶点提供了重要的筛选数据基础。
【数据集背景】
小细胞肺癌是一种具有高度侵袭性的神经内分泌肿瘤，其发生发展涉及复杂的转录调控网络。DLL3 作为 Notch 信号通路的相关配体，在小细胞肺癌中呈现特异性高表达，已成为该疾病领域备受关注的分子标志物和潜在治疗靶点。然而，DLL3 表达的上游转录调控机制尚需深入解析。该数据集正是围绕这一科学问题展开，通过 CRISPR 筛选策略，系统性地寻找调控 DLL3 表达的转录因子，最终将 POU2F1 鉴定为 DLL3 表达的新型转录调控因子。这一发现为理解小细胞肺癌中 DLL3 的表达调控提供了新的视角，也为后续研究神经内分泌谱系转录程序奠定了基础。
【数据内容】
该数据集的核心内容为 CRISPR 筛选数据，用于鉴定调控 DLL3 表达的转录调控因子。根据源站描述，研究通过 CRISPR 筛选识别出 POU2F1 是 SCLC 中 DLL3 表达的新型转录调控因子。此外，研究还结合遗传学和表观基因组学方法，验证了 POU2F1 和 ASCL1 能够激活 DLL3 表达以及神经内分泌谱系转录程序。因此，数据集涉及的内容涵盖 CRISPR 筛选结果，以及与 POU2F1、ASCL1、DLL3 表达调控和神经内分泌谱系转录程序相关的验证性数据。关于数据的具体样本数量、筛选文库、测序深度、数据文件格式等详细信息，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 数据库中的公开数据资源。数据集名称中包含“[CRISPR Screen]”标识，表明其数据采集方式基于 CRISPR 筛选技术。研究通过 CRISPR 筛选结合遗传学与表观基因组学方法，对小细胞肺癌中 DLL3 表达的调控因子进行鉴定与验证。关于具体的细胞系、实验条件、筛选时间点、测序平台等采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于小细胞肺癌相关的基础与转化研究，尤其是围绕 DLL3 表达调控机制、神经内分泌谱系转录程序以及转录因子功能研究的方向。具体而言，可用于分析 CRISPR 筛选鉴定的候选调控因子，研究 POU2F1 和 ASCL1 在 DLL3 表达激活中的作用，以及探索小细胞肺癌中神经内分泌谱系相关转录程序的调控网络。此外，该数据集也可能为以 DLL3 为靶点的治疗策略研究提供分子机制层面的参考。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集来源于 NCBI 公开数据库，用户可通过 ncbi.nlm.nih.gov 访问相关数据。由于数据集标识为 CRISPR 筛选数据，使用者可根据 CRISPR 筛选数据的常规分析流程进行处理，例如筛选候选基因、评估基因富集情况以及结合遗传学和表观基因组学验证结果进行综合分析。关于该数据集的具体下载方式、数据处理步骤、推荐分析工具或流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 CRISPR 筛选技术，并结合遗传学和表观基因组学方法进行验证，研究结论指向 POU2F1 和 ASCL1 作为 DLL3 表达的转录共调控因子。然而，关于该数据集的质量评估指标、数据完整性、批次效应、假阳性或假阴性控制情况、样本量大小以及实验重复次数等具体信息，源站未提供。因此，使用者在解释和应用该数据集时，应结合源站提供的原始描述和自身研究需求进行判断。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），具体引用方式、作者信息、发表文献以及数据使用许可条款，源站未提供。使用者在使用该数据集时，应遵循 NCBI 及相关数据发布方的使用规范，并查阅源站获取最新的引用与许可信息。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317998
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们进行了CRISPR筛选，鉴定出POU2F1是SCLC中DLL3表达的一种新型转录调控因子。我们采用遗传学和表观基因组学方法验证了POU2F1和ASCL1可激活DLL3表达以及神经内分泌谱系转录程序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
