GDC MATCH-C1:基因组特征 CS-MATCH-0007 Arm C1
该数据集来自 NCI Genomic Data Commons 的 MATCH 计划,项目编号 MATCH-C1(CS-MATCH-0007 Arm C1),涵盖食管、支气管与肺、胃、肝及肝内胆管、腭等原发部位,疾病类型包括痣与黑色素瘤、腺瘤与腺癌及未特指肿瘤

基本信息
资源简介
GDC MATCH-C1:基因组特征 CS-MATCH-0007 Arm C1
该数据集来自 NCI Genomic Data Commons 的 MATCH 计划,项目编号 MATCH-C1(CS-MATCH-0007 Arm C1),涵盖食管、支气管与肺、胃、肝及肝内胆管、腭等原发部位,疾病类型包括痣与黑色素瘤、腺瘤与腺癌及未特指肿瘤。数据包含临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化与影像数据,分为开放与受控访问层级,共 11 例病例、263 个文件,总大小约 1076.2 GB,可用于肿瘤基因组特征分析与分类研究(来源 portal.gdc.cancer.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):GDC 项目 MATCH-C1(基因组特征 CS-MATCH-0007 Arm C1)。原发部位:食管、支气管与肺、胃、肝及肝内胆管、腭。疾病类型:痣与黑色素瘤、腺瘤与腺癌、肿瘤,NOS。计划:MATCH。病例数:11。文件数:263。总大小:1076.2 GB。NCI Genomic Data Commons 协调的癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据;开放与受控访问层级)。
【主题与分类】
主题标签:Nevi and Melanomas、Adenomas and Adenocarcinomas、Neoplasms, NOS。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/MATCH-C1
下载信息
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数据集获取
源站:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/MATCH-C1
标准获取流程:
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1155.56 GB。
数据说明
GDC项目MATCH-C1(基因组特征分析CS-MATCH-0007 C1组)。原发部位:食管、支气管和肺、胃、肝及肝内胆管、腭。疾病类型:痣和黑色素瘤、腺瘤和腺癌、肿瘤,NOS。项目:MATCH。病例数:11。文件数:263。总大小:1076.2 GB。NCI基因组数据共享统一癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据;开放和受控访问层级)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




