肺癌患者血液与组织DNA分析
本数据集来自clinicaltrials.gov,主题为肺癌患者血液与组织的DNA分析,属于肿瘤/肺癌领域。其研究目标涵盖评估遗传多态性在肺癌风险中的作用,包括DNA修复基因、p53通路基因及基质金属蛋白酶基因的胚系多态性,并分析性别、年龄对遗传易感性的影响,以及基因-饮食交互作用、特定组织学亚型风

基本信息
资源简介
肺癌患者血液与组织DNA分析
本数据集英文名为 DNA Analysis of Blood and Tissue From Patients With Lung Cancer,来源于 clinicaltrials.gov,本站归类为肿瘤 / 肺癌领域,主题标签为 Lung Cancer。该数据集围绕肺癌患者血液与组织样本中的 DNA 分析展开,研究目标涵盖评估遗传多态性在肺癌风险中的作用,包括 DNA 修复基因、p53 通路基因及基质金属蛋白酶基因(肿瘤侵袭因子)的胚系多态性,并分析性别、年龄对遗传易感性的影响,以及基因-饮食交互作用、特定组织学亚型风险等方向。数据集还关注持续暴露于主流烟草烟雾和/或二手烟草烟雾是否与接受治疗的肺癌患者较差的临床预后相关。整体而言,该数据集属于肿瘤遗传学与流行病学交叉领域的研究资源,可用于探索肺癌遗传易感性及其与环境、生活方式因素的交互关系。
【数据集背景】
肺癌是全球范围内发病率和死亡率较高的恶性肿瘤之一,其发生发展涉及遗传因素与环境暴露的复杂交互。本数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦于肺癌患者血液与组织样本的 DNA 分析,旨在从遗传多态性角度探讨肺癌风险的影响因素。研究背景涉及遗传易感性、DNA 修复机制、p53 通路、基质金属蛋白酶介导的肿瘤侵袭,以及烟草暴露与临床预后之间的关系。该数据集所属分类为肿瘤 / 肺癌,主题标签为 Lung Cancer,适合用于肺癌遗传流行病学及相关转化研究。
【数据内容】
该数据集的核心内容为肺癌患者血液与组织样本的 DNA 分析。根据源站描述,研究目标包括:评估遗传多态性在肺癌患者肺癌风险中的作用;在调整潜在混杂因素后,评估 DNA 修复基因、p53 通路基因及基质金属蛋白酶基因(肿瘤侵袭因子)的胚系多态性在肺癌风险中的作用;评估性别和年龄在肺癌遗传易感性中的作用;评估遗传多态性对饮食-肺癌风险关联的修饰作用,包括基因-饮食交互作用,以及探索性的基因-性别-饮食和基因-基因-饮食交互作用;在仅病例分析中评估多态性对特定组织学亚型肺癌发生风险的作用;确定持续暴露于主流烟草烟雾和/或二手烟草烟雾是否与接受治疗的肺癌患者较差的临床预后相关。数据内容涉及血液与组织样本的 DNA 分析结果,以及与之相关的遗传多态性、饮食、性别、年龄、烟草暴露和临床预后等信息。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 clinicaltrials.gov。源站描述中列出的研究条件为 Lung Cancer。数据采集涉及肺癌患者的血液与组织样本,用于 DNA 分析。源站描述中未提供具体的采集时间、采集地点、样本量、随访周期等细节,源站未提供。数据来源为临床研究注册信息,属于肿瘤 / 肺癌领域,主题标签为 Lung Cancer。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌遗传易感性研究,尤其是涉及 DNA 修复基因、p53 通路基因和基质金属蛋白酶基因多态性的分析。可用于评估遗传多态性与肺癌风险的关联,分析性别和年龄对遗传易感性的影响,探讨基因-饮食交互作用,以及研究特定组织学亚型肺癌的风险因素。此外,还可用于分析烟草暴露与肺癌患者临床预后之间的关系。适用场景包括肿瘤流行病学、遗传学、分子生物学及临床预后研究等方向。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。该数据集来源于 clinicaltrials.gov,用户可根据源站描述中的研究目标和条件,结合自身研究需求进行探索性分析。由于源站未提供数据格式、访问方式、变量定义或分析工具等信息,具体使用方法需参考源站进一步获取。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本代表性、数据完整性、偏倚控制或验证结果的具体信息。该数据集基于临床研究注册信息,研究目标涵盖多个遗传多态性、饮食、性别、年龄、烟草暴露和临床预后等变量,但源站描述中未提供样本量、统计功效、混杂因素调整细节或数据缺失情况。因此,在使用时需注意源站未提供的质量与限制信息,并结合研究设计进行审慎评估。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可条款。该数据集来源于 clinicaltrials.gov,用户在使用时应遵循源站的相关规定。由于源站未提供具体的引用与许可信息,建议直接查阅 clinicaltrials.gov 上该数据集的注册页面以获取最新、最准确的引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT00471978
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
疾病:肺癌。目的:* 评估遗传多态性在肺癌患者肺癌风险中的作用。* 在调整潜在混杂因素后,评估DNA修复基因、p53通路基因和基质金属蛋白酶基因(肿瘤侵袭因子)的种系多态性在肺癌风险中的作用。* 评估性别和年龄在肺癌遗传易感性中的作用。* 评估遗传多态性在调节饮食-肺癌风险关联中的作用(基因-饮食以及探索性的基因-性别-饮食和基因-基因-饮食交互作用)。* 在仅病例分析中,评估多态性在发生特定组织学亚型肺癌风险中的作用。* 确定持续暴露于主流和/或二手烟草烟雾是否与接受肺癌治疗的患者较差的临床预后相关。大纲:本研究最初为病例对照研究,但目前仅为病例研究。从患者和对照者采集血样。样本通过聚合酶链反应分析基因多态性。
拟研究的基因包括GSTP1、GSTM1、GSTT1、ERCC2、XRCC1、EPHX、NAT-2、p53基因、CYP1A1、NQO1、MnSOD和GPX1。接受手术患者的组织样本及血液样本被存档,以供未来研究之用。患者和对照组完成关于饮食、病史及职业/环境史的问卷调查。预计招募人数:本研究早期阶段将招募共计3,400名患者和3,400名对照者。总招募人数将达到15,000人。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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