生成rIPD、表格与图表的数据集及代码

CSV文件是数据集,包含免疫治疗和化疗KM曲线在指定时间点的时间和生存率。以'hn'开头的CSV文件表示头颈癌,'b'表示膀胱癌

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表格回归肿瘤肺癌免疫治疗化疗KM曲线rIPD头颈癌膀胱癌
Dataset & Code for generating rIPD, tables, and figures

基本信息

模态
表格
大小
0.001075805 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

生成rIPD、表格与图表的数据集及代码

本数据集名为“Dataset & Code for generating rIPD, tables, and figures”,由作者Choi, Donghwi发布,机构为Zenodo,发布时间为2026年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。数据集属于肿瘤/肺癌领域,来源站为doi.org。其核心内容是一组CSV文件,记录了免疫治疗与化疗的Kaplan-Meier(KM)曲线在指定时间点上的时间与生存率数据,并配套提供R代码,用于生成重建个体患者数据(rIPD)、表格及图形。CSV文件命名规则具有明确含义:以“hn”开头表示头颈癌,以“b”开头表示膀胱癌,不以字母开头的文件则对应非小细胞肺癌(NSCLC)。文件名中的数字与Word文件中同一编号行的论文相对应,这些Word文件分别命名为“NSCLC”“Head&Neck”和“Bladder”。该数据集仅纳入了各研究中展示KM曲线且包含最多患者数的行,并据此进行分析与上传。

【数据集背景】

该数据集面向肿瘤学中免疫治疗与化疗的生存分析比较研究。在临床研究中,KM曲线是展示时间-事件终点(如总生存期)的常用工具,但原始个体患者数据往往难以获取。本数据集通过提供从已发表KM曲线中提取的时间与生存率数据,并结合R代码及来自各论文的风险患者数,支持重建个体患者数据(rIPD),从而为后续的统计建模、二次分析或方法学验证提供数据基础。其覆盖的癌种包括非小细胞肺癌、头颈癌和膀胱癌,其中非小细胞肺癌属于本站分类中的肺癌范畴。

【数据内容】

数据集以CSV文件为核心,每个文件包含特定时间点及其对应的生存率,用于描述免疫治疗(曲线1)和化疗(曲线2)的KM曲线。文件命名规则明确:以“hn”开头的CSV文件表示头颈癌,以“b”开头的表示膀胱癌,不以字母开头的文件表示非小细胞肺癌。文件名中的数字与Word文件(分别命名为“NSCLC”“Head&Neck”和“Bladder”)中同一编号行的论文相对应。此外,数据集还包含R代码,以及来自各论文的风险患者数,这些内容共同用于生成rIPD、表格和图形。需要说明的是,仅各研究中展示KM曲线且包含最多患者数的行被选中并上传至此。

【采集与来源】

数据来源于已发表的论文,具体论文信息通过Word文件“NSCLC”“Head&Neck”和“Bladder”中的编号行进行关联。CSV文件中的时间与生存率数据系从这些论文的KM曲线中提取。来源站为doi.org,数据集发布机构为Zenodo。作者为Choi, Donghwi。关于原始论文的具体筛选标准、提取流程的详细步骤,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要基于已发表KM曲线进行生存分析二次研究的场景,例如重建个体患者数据以开展网络Meta分析、验证生存外推方法、生成汇总表格或图形等。由于覆盖非小细胞肺癌、头颈癌和膀胱癌,并区分免疫治疗与化疗,可用于比较这两种治疗方式在不同癌种中的生存曲线特征。此外,配套的R代码可用于复现rIPD生成过程,适合方法学研究人员或统计分析师使用。

【使用方法】

使用者可依据CSV文件中的时间与生存率数据,结合R代码以及各论文中的风险患者数,生成rIPD。文件命名规则有助于快速识别癌种:以“hn”开头为头颈癌,以“b”开头为膀胱癌,不以字母开头为非小细胞肺癌。文件名中的数字应与Word文件“NSCLC”“Head&Neck”或“Bladder”中同一编号行的论文对应,以获取该研究的具体信息。曲线1对应免疫治疗,曲线2对应化疗。关于R代码的具体运行环境、依赖包及操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅纳入了各研究中展示KM曲线且包含最多患者数的行,这可能导致其他包含较少患者数的曲线未被收录。数据提取自已发表的KM曲线,其精度受原始图形分辨率及提取方法影响。此外,数据集仅覆盖非小细胞肺癌、头颈癌和膀胱癌,未涵盖其他癌种。关于数据的完整性、准确性验证及潜在偏倚,源站未提供更多信息。

【引用与许可】

本数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,允许在署名前提下共享与改编。引用时需注明作者Choi, Donghwi、发布机构Zenodo及发布时间2026。关于具体的引用格式或DOI信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.20740666

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.1 MB。

数据说明

CSV文件是包含免疫治疗和化疗KM曲线在特定时间点的时间与生存率的数据集。曲线1为免疫治疗,曲线2为化疗。以“hn”开头的CSV文件表示头颈癌,“b”代表膀胱癌。不以字母开头的文件表示NSCLC。CSV文件名中的数字与名为“NSCLC”、“Head&Neck”和“Bladder”的Word文件中同一编号行对应的论文相关联。仅选取了展示特定研究中包含最多患者数量的KM曲线的行进行分析,因此上传至此。利用R代码、CSV文件以及各论文中的风险患者数,生成了rIPD。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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