Crowds Cure Cancer:RSNA 2018 年会众包采集数据

The Cancer Imaging Archive(TCIA)已获取大量影像数据,可作为改进机器学习算法的宝贵训练集。然而,这些数据集缺乏一致的病灶标注

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医学影像关键点标注肿瘤肺癌病灶标注众包数据CT影像TCIA
Crowds Cure Cancer: Crowdsourced data collected at the RSNA 2018 annual meeting

基本信息

模态
医学影像
任务类型
关键点标注
许可
Creative Commons Attribution 3.0 Unported
创建/更新时间
2026-10-23
版本
1

资源简介

Crowds Cure Cancer:RSNA 2018 年会众包采集数据

The Cancer Imaging Archive(TCIA)已获取大量影像数据,可作为改进机器学习算法的宝贵训练集。然而,这些数据集缺乏一致的病灶标注

Crowds Cure Cancer: Crowdsourced data collected at the RSNA 2018 annual meeting

【数据集背景】

源站首次发布:2019。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):The Cancer Imaging Archive(TCIA)已获取大量影像数据,可作为改进机器学习算法的宝贵训练集。然而,这些数据集缺乏一致的病灶标注。为解决这一问题,Frederick National Laboratory for Cancer Research(FNLCR)的癌症影像信息学实验室与 National Cancer Institute 的 Informatics Technology for Cancer Research 项目资助的五个团队合作,开发了一个基于网络的众包应用来收集病灶标注,并在 Radiological Society of North America(RNSA)2018 年会上展示。Crowds Cure Cancer( RSNA 2017 上展出,使用来自 4 个不同 TCIA 采集集的 CT 扫描。参与者被要求对最大病灶进行一维测量。没有提供详细信息的选项。

【主题与分类】

主题标签:肿瘤、肺癌、病灶标注、众包数据、CT影像、TCIA。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/analysis-result/crowds-cure-2018/

使用许可:Creative Commons Attribution 3.0 Unported。

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源站:https://doi.org/10.7937/tcia.2019.yk0gm1eb

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症影像档案(The Cancer Imaging Archive,TCIA)已获取了大量图像数据,这些数据可作为改进机器学习算法的宝贵训练集。然而,这些数据集缺乏一致的病灶标注。为解决这一问题,弗雷德里克国家癌症研究实验室(Frederick National Laboratory for Cancer Research,FNLCR)的癌症影像信息学实验室与由美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)癌症研究信息学技术项目资助的五个团队建立了合作关系,共同开发了一款基于网络的众包应用程序,用于收集病灶标注,并在北美放射学会(Radiological Society of North America,RSNA)2018年年会上进行了展示。Crowds Cure Cancer(https://www.crowds-cure.org)首次在RSNA 2017上展出,使用了来自4个不同TCIA集合的CT扫描。参与者被要求对最大病灶进行一维测量。当时没有选项可供提供有关成像质量(例如,无静脉造影、运动伪影等)、病灶位置(例如,肺、肝等)或病灶特征(例如,边界不清、磨玻璃样等)的详细信息,因此需要在收集后进行额外的图像审查。

2017年数据集可在https://doi.org/10.7937/K9/TCIA.2018.OW73VLO2获取。针对RSNA 2018,应用程序经过重新设计,以促进更全面的数据收集并增加社区参与度。参与者被指导识别所有转移性疾病,并提供关于图像质量、病变位置和特征的详细信息。为进一步激励参与,我们通过增加游戏化功能(例如奖励徽章)改进了系统,并创建了排行榜以展示参与者排名。需要标注的数据量也显著增加,包括来自13个TCIA集合的CT扫描:Anti-PD-1_Lung、Anti-PD-1_MELANOMA、CPTAC-CCRCC、CPTAC-GBM、CPTAC-HNSCC、CPTAC-PDA、CPTAC-UCEC、NSCLC Radiogenomics、TCGA-BLCA、TCGA-COAD、TCGA-HNSC、TCGA-LUSC、TCGA-UCEC。在RSNA 2018期间,4756个双向

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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